67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3896 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  100 
 
 		 117 aa  243  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  84.48 
 
 		 117 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  83.62 
 
 		 117 aa  207  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  75 
 
 		 117 aa  197  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  77.59 
 
 		 117 aa  197  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  75 
 
 		 117 aa  194  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  74.58 
 
 		 119 aa  192  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  83.62 
 
 		 117 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  78.79 
 
 		 101 aa  176  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  51.72 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  47.41 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  39.84 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  39.02 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  35.48 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  39.25 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  35.77 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  34.75 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  37.38 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  36.29 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  37.04 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  34.51 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  33.9 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  37.72 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  36.61 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  30.51 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  31.87 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  39.76 
 
 		 172 aa  60.1  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  37.04 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  36.08 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  29.52 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  27.42 
 
 		 596 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  29.82 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  36.14 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  28.46 
 
 		 596 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  30.77 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  35.29 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  33.91 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.77 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  29.21 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  32.61 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  30.25 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  28.04 
 
 		 596 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  26.02 
 
 		 596 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  32.26 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  30.3 
 
 		 597 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  27.36 
 
 		 583 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.53 
 
 		 596 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  30.3 
 
 		 596 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  30.53 
 
 		 596 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  30.53 
 
 		 596 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  28.71 
 
 		 596 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  28.71 
 
 		 596 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  28.71 
 
 		 596 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  28.71 
 
 		 596 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  28.7 
 
 		 588 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  35.9 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  34.41 
 
 		 589 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  36.71 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  25.64 
 
 		 591 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.71 
 
 		 589 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.62 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  33.9 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.19 
 
 		 114 aa  43.9  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  25 
 
 		 593 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0627  hypothetical protein  30 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.593343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  33.75 
 
 		 589 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  29.49 
 
 		 596 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>