More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4752 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  97.41 
 
 
541 aa  1093    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  100 
 
 
541 aa  1120    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  98.52 
 
 
541 aa  1104    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  97.97 
 
 
541 aa  1098    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  97.97 
 
 
541 aa  1099    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  82.26 
 
 
248 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  82.26 
 
 
248 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  82.26 
 
 
248 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3046  SAM-dependent methyltransferase  72.18 
 
 
248 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  72.18 
 
 
248 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  72.58 
 
 
248 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  72.58 
 
 
248 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  70.97 
 
 
248 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  72.18 
 
 
248 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  72.58 
 
 
248 aa  382  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  71.37 
 
 
248 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  70.56 
 
 
248 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2793  hypothetical protein  71.37 
 
 
248 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  71.37 
 
 
248 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1432  hypothetical protein  70.97 
 
 
248 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802657  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1856  hypothetical protein  70.97 
 
 
248 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  0.598585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  72.98 
 
 
254 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  69.76 
 
 
248 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  69.76 
 
 
248 aa  368  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  71.37 
 
 
248 aa  364  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  69.76 
 
 
248 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  62.9 
 
 
248 aa  335  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  46.53 
 
 
249 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  34.14 
 
 
275 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  34.68 
 
 
254 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  28.86 
 
 
245 aa  123  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  32.9 
 
 
281 aa  120  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  29.48 
 
 
227 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  31.74 
 
 
277 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  39.87 
 
 
280 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  39.87 
 
 
280 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_586  methyltransferase  38.16 
 
 
293 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00349861  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0618  methyltransferase type 12  36.84 
 
 
280 aa  103  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00582618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  29.25 
 
 
247 aa  90.9  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  24.77 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  27.54 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.83 
 
 
243 aa  76.3  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.83 
 
 
234 aa  76.3  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  30.33 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  29.91 
 
 
266 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.86 
 
 
254 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  35.51 
 
 
245 aa  69.3  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.81 
 
 
238 aa  68.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  25.32 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.2 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.86 
 
 
237 aa  67  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  31.43 
 
 
215 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  28.5 
 
 
254 aa  67  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  27.23 
 
 
247 aa  67  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 
239 aa  67  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  24.41 
 
 
267 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  25.5 
 
 
252 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.79 
 
 
245 aa  65.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  25 
 
 
259 aa  65.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  27.78 
 
 
196 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  35.38 
 
 
203 aa  65.1  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  35.09 
 
 
263 aa  65.1  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  28.35 
 
 
233 aa  65.1  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  28.87 
 
 
255 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  24.57 
 
 
248 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  24.73 
 
 
253 aa  64.7  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4911  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.5 
 
 
270 aa  64.3  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.168902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  25.35 
 
 
251 aa  64.3  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.82 
 
 
239 aa  63.9  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
236 aa  63.9  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
238 aa  63.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
280 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  26.04 
 
 
262 aa  63.5  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.95 
 
 
230 aa  63.5  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.45 
 
 
242 aa  63.5  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  39.05 
 
 
323 aa  63.5  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 
261 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
197 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  26.37 
 
 
237 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
675 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 
232 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  32.03 
 
 
190 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
276 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  30.08 
 
 
272 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  30.08 
 
 
272 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.97 
 
 
232 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
255 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  30.08 
 
 
272 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  35.8 
 
 
236 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.07 
 
 
239 aa  62  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.16 
 
 
230 aa  62  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
232 aa  62  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  35.8 
 
 
236 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  35.8 
 
 
236 aa  61.6  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>