225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1829 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 242 aa  499  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3378  LamB/YcsF family protein  52.7 
 
 		 249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  0.571628 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05795  LamB/YcsF family protein  53.11 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3199  LamB/YcsF family protein  53.94 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37270  LamB/YcsF family protein  53.53 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000305457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  51.87 
 
 		 250 aa  272  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1983  LamB/YcsF family protein  52.32 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  51.87 
 
 		 259 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  51.87 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  51.87 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000162  lactam utilization protein LAMB  51.87 
 
 		 251 aa  265  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.078695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  50.62 
 
 		 259 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  50.21 
 
 		 250 aa  264  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0716  LamB/YcsF family protein  50.62 
 
 		 246 aa  261  6e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0495612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  51.04 
 
 		 251 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  51.04 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12450  hypothetical protein  49.79 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.858403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0807  hypothetical protein  49.79 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0361  LamB/YcsF family protein  47.7 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.135278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3547  LamB/YcsF family protein  50.21 
 
 		 243 aa  254  6e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1497  LamB/YcsF family protein  49.79 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.910801  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1436  LamB/YcsF family protein  47.28 
 
 		 246 aa  241  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  48.54 
 
 		 255 aa  231  9e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01080  LamB/YcsF family protein  45.45 
 
 		 245 aa  230  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  48.12 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  48.12 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  43.98 
 
 		 254 aa  228  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1736  LamB/YcsF family protein  42.44 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  43.1 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  46.86 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  42.32 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  47.72 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  42.32 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  42.32 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  42.32 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  44.59 
 
 		 253 aa  221  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  41.91 
 
 		 253 aa  221  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  44.77 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  41.91 
 
 		 253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  46.47 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  45.61 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  46.06 
 
 		 256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  42.32 
 
 		 250 aa  214  9e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  43.51 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  45.23 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 		 252 aa  211  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  45.64 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  45.19 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  43.98 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  44.73 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  44.73 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  48.76 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  43.8 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  43.98 
 
 		 251 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  43.57 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  43.51 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  43.8 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  42.56 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  43.57 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  44.77 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  41.74 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  42.32 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  45.81 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  43.93 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  40.91 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  43.57 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  43.93 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  43.93 
 
 		 304 aa  195  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  45.19 
 
 		 257 aa  194  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  42.56 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  42.56 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  41.78 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  39 
 
 		 274 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  39.76 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  41.74 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  40.08 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  41.91 
 
 		 253 aa  191  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  44.49 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 		 260 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  42.68 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1386  LamB/YcsF family protein  43.51 
 
 		 266 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.624042 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  39.67 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  41.32 
 
 		 254 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  39.26 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  41.08 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  41.49 
 
 		 253 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  38.78 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  44.4 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  43.15 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  41.33 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  42.44 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  41.49 
 
 		 260 aa  185  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>