225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2917 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  68.25 
 
 		 254 aa  330  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  64.71 
 
 		 260 aa  328  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  54.58 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2592  LamB/YcsF family protein  51.18 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7659  LamB/YcsF family protein  51.82 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6367  LamB/YcsF family protein  51.45 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.826752 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  51.39 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  48.03 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  45.63 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4552  LamB/YcsF family protein  49.79 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.152048 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  44.86 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 		 257 aa  231  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  44.86 
 
 		 255 aa  231  9e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  44.44 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  44.84 
 
 		 254 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  44.66 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  44.44 
 
 		 256 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  45.06 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  44.22 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  44.44 
 
 		 253 aa  221  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  45.2 
 
 		 255 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  44.03 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  45.49 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  45.04 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  43.75 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  45.82 
 
 		 251 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  47.01 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  43.78 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  43.2 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  41.56 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  42.8 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  42.8 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  43.39 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  43.62 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  43.39 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  44.66 
 
 		 258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2055  LamB/YcsF family protein  46.28 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  47.74 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  43.75 
 
 		 253 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  43.8 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  45.04 
 
 		 258 aa  211  9e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  42.15 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 260 aa  210  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  49.21 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  42.39 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 		 256 aa  208  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  42.06 
 
 		 255 aa  208  8e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  45.08 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  43.85 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  43.8 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  41.37 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  40.39 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  47.08 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  41.39 
 
 		 251 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  43.57 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  43.78 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  46.4 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  40.98 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  44.9 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  42.56 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  42.86 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  43.03 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  41.34 
 
 		 274 aa  198  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  42.64 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  45.08 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  40 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1497  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  44.27 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  46.91 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  41.74 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  44.67 
 
 		 246 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  42.17 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  39.11 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  38.93 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  42.17 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  42.17 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  38.93 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  44.22 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  43.81 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  43.39 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  43.44 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 		 301 aa  192  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1386  LamB/YcsF family protein  42.23 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.624042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  39.04 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  42.11 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2862  hypothetical protein  43.95 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.477951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  43.03 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  43.87 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01080  LamB/YcsF family protein  42.39 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  40.57 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  43.44 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  37.7 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>