225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1143 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  100 
 
 
257 aa  531  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  53.41 
 
 
258 aa  280  1e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  53.97 
 
 
256 aa  271  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  48.03 
 
 
255 aa  267  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  48.03 
 
 
255 aa  267  2e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  49.01 
 
 
254 aa  266  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  48.03 
 
 
255 aa  265  5.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  51.22 
 
 
254 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  49.21 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 
252 aa  249  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  47.98 
 
 
251 aa  249  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  49 
 
 
261 aa  249  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 
252 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 
253 aa  249  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  47.81 
 
 
255 aa  249  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 
250 aa  248  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 
250 aa  248  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 
253 aa  247  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  45.24 
 
 
256 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  45.42 
 
 
274 aa  247  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 
255 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  47.81 
 
 
257 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  46.59 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  46.59 
 
 
253 aa  245  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 
253 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 
253 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  46.64 
 
 
254 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 
255 aa  242  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  46.59 
 
 
253 aa  241  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 
255 aa  241  9e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  46.94 
 
 
255 aa  241  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 
255 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  45.82 
 
 
256 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 
251 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  47.22 
 
 
257 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  45.42 
 
 
254 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  46.88 
 
 
260 aa  237  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  46.18 
 
 
254 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  45.63 
 
 
256 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  44.84 
 
 
255 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 
256 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  45.78 
 
 
253 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 
250 aa  236  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  47.81 
 
 
256 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 
252 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 
255 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  47.72 
 
 
250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  46.67 
 
 
304 aa  235  6e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 
253 aa  234  8e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 
253 aa  234  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0005  hypothetical protein  47.18 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76896  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  49 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  46.18 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  46.77 
 
 
254 aa  232  5e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  47.76 
 
 
257 aa  231  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2055  LamB/YcsF family protein  46.4 
 
 
257 aa  228  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  43.55 
 
 
254 aa  228  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 
264 aa  228  9e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 
254 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 
254 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 
254 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0716  LamB/YcsF family protein  46.91 
 
 
246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0495612  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1723  hypothetical protein  45.24 
 
 
266 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0366  hypothetical protein  45.24 
 
 
266 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0274  hypothetical protein  45.24 
 
 
266 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000162  lactam utilization protein LAMB  46.5 
 
 
251 aa  224  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.078695  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 
262 aa  224  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 
252 aa  224  9e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 
249 aa  224  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4034  LamB/YcsF family protein  44.62 
 
 
253 aa  223  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1880  hypothetical protein  44.84 
 
 
266 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0893  hypothetical protein  44.84 
 
 
266 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1179  hypothetical protein  44.84 
 
 
266 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2156  hypothetical protein  44.84 
 
 
266 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 
256 aa  222  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  43.95 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4577  hypothetical protein  45.24 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00594696  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3259  hypothetical protein  45.38 
 
 
259 aa  222  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.990579  normal  0.190994 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3547  LamB/YcsF family protein  48.05 
 
 
243 aa  221  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  44.44 
 
 
254 aa  220  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5865  hypothetical protein  43.08 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  44.22 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  48.8 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 
250 aa  218  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 
260 aa  218  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  45.61 
 
 
242 aa  217  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  42.34 
 
 
260 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 
253 aa  217  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  47.18 
 
 
255 aa  217  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  45.04 
 
 
256 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05795  LamB/YcsF family protein  45.27 
 
 
251 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 
246 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06420  hypothetical protein  42.86 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  43.48 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>