225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1948 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  76.71 
 
 		 256 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  61.6 
 
 		 253 aa  334  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  60.4 
 
 		 253 aa  332  5e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  60.4 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  60.8 
 
 		 253 aa  328  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  60.48 
 
 		 254 aa  328  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  59.6 
 
 		 253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  58.8 
 
 		 253 aa  325  5e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  59.6 
 
 		 253 aa  324  7e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  58.8 
 
 		 253 aa  321  5e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  58.8 
 
 		 253 aa  321  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  58.17 
 
 		 252 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  56.85 
 
 		 274 aa  294  7e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  55.2 
 
 		 250 aa  294  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  55.2 
 
 		 250 aa  294  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  52.59 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  51.79 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  51.79 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  51.39 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  54.62 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 		 254 aa  275  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  51.2 
 
 		 255 aa  274  8e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  55.47 
 
 		 245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  55.47 
 
 		 245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  55.47 
 
 		 245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0871  LamB/YcsF family protein  55.87 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  50.8 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  55.06 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0761  LamB/YcsF family protein  55.47 
 
 		 244 aa  271  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  53.82 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0822  LamB/YcsF family protein  55.02 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0506032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0803  LamB/YcsF family protein  53.82 
 
 		 244 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.179932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0774  LamB/YcsF family protein  55.47 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.846244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  52.61 
 
 		 256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0837  LamB/YcsF family protein  55.06 
 
 		 244 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610355 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  55.93 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  55.93 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  55.93 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  53.85 
 
 		 245 aa  268  8e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  55.51 
 
 		 244 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  51 
 
 		 258 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  55.51 
 
 		 244 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  54.62 
 
 		 245 aa  268  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  55.08 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  52.21 
 
 		 254 aa  262  4.999999999999999e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1138  LamB/YcsF family protein  52 
 
 		 245 aa  261  6e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  51.02 
 
 		 247 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  51.43 
 
 		 247 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  51.02 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  51.43 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  55.51 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1228  LamB/YcsF family protein  51.6 
 
 		 245 aa  254  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  53.63 
 
 		 260 aa  254  9e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2920  LamB/YcsF family protein  55.2 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  48.99 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  48.58 
 
 		 262 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  48.58 
 
 		 254 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  48.58 
 
 		 254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  48.58 
 
 		 254 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  48.58 
 
 		 254 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  48.58 
 
 		 254 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  48.58 
 
 		 254 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  47.37 
 
 		 250 aa  250  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  47.98 
 
 		 257 aa  249  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  47.77 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  50 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  48.99 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 254 aa  244  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 274 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 274 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 		 254 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  47.39 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  48.78 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  50.4 
 
 		 256 aa  234  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  48.16 
 
 		 252 aa  234  9e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3108  LamB/YcsF family protein  50.4 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  46.43 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2827  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 		 245 aa  231  7.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  hitchhiker  0.00875882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  45.9 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0027  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 		 247 aa  228  6e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.529091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  43.6 
 
 		 255 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  47.39 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  49.38 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  46.12 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>