225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0986 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  100 
 
 
254 aa  521  1e-147  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 
251 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 
253 aa  258  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  51.41 
 
 
253 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  51.41 
 
 
253 aa  255  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  51.41 
 
 
253 aa  254  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  51.81 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  51.05 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  51.42 
 
 
258 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  50.62 
 
 
274 aa  250  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 
253 aa  250  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  51.22 
 
 
256 aa  250  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 
254 aa  250  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 
253 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 
253 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 
254 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 
253 aa  247  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  48.18 
 
 
252 aa  244  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  47.77 
 
 
250 aa  244  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  47.77 
 
 
250 aa  244  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 
255 aa  241  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 
255 aa  239  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  50.21 
 
 
256 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 
255 aa  238  5e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 
255 aa  238  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 
252 aa  237  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 
254 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  44.98 
 
 
255 aa  236  3e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 
254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  46.96 
 
 
250 aa  234  9e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  46.94 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  44.84 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 
257 aa  232  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  45.82 
 
 
255 aa  231  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 
254 aa  231  7.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  47.98 
 
 
262 aa  230  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  47.3 
 
 
253 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  51.11 
 
 
258 aa  228  9e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 
255 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  46.56 
 
 
253 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  47.92 
 
 
254 aa  224  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  49.79 
 
 
251 aa  223  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  47.92 
 
 
254 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  43.55 
 
 
252 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  47.92 
 
 
254 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  47.92 
 
 
254 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  47.92 
 
 
254 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  47.3 
 
 
262 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  47.5 
 
 
254 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  47.5 
 
 
254 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  44.13 
 
 
244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 
244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  44.13 
 
 
244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 
244 aa  219  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 
244 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  44.62 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 
256 aa  218  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.815905 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 
244 aa  218  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 
244 aa  218  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  43.32 
 
 
244 aa  218  8.999999999999998e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  43.82 
 
 
256 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  47.92 
 
 
254 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  47.92 
 
 
254 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 
254 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 
245 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 
245 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 
245 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  42.91 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  45 
 
 
250 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  42.91 
 
 
246 aa  215  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  44.81 
 
 
256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  47.41 
 
 
256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 
250 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  43.55 
 
 
255 aa  215  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  43.33 
 
 
255 aa  214  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0803  LamB/YcsF family protein  43.32 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.179932  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  43.55 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  47.08 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  43.55 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  43.2 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  47.5 
 
 
274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  47.5 
 
 
274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  43.32 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  44.77 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  43.93 
 
 
255 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  45.19 
 
 
260 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  42.68 
 
 
256 aa  210  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  42.57 
 
 
252 aa  210  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1228  LamB/YcsF family protein  43.67 
 
 
245 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2055  LamB/YcsF family protein  44.08 
 
 
257 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 
245 aa  208  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  42.5 
 
 
255 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  43.17 
 
 
252 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 
254 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1497  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 
251 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258316  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>