225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3294 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 255 aa  508  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  72 
 
 		 256 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  71.37 
 
 		 254 aa  348  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  66.8 
 
 		 254 aa  348  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  68.83 
 
 		 252 aa  335  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  69.35 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  68.27 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  68.7 
 
 		 255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  59.68 
 
 		 252 aa  301  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  62.8 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  59.27 
 
 		 254 aa  293  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  58.23 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  59.68 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  60.24 
 
 		 254 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  60.24 
 
 		 254 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  60.24 
 
 		 254 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  57.79 
 
 		 254 aa  279  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  56.73 
 
 		 254 aa  271  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  57.96 
 
 		 251 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  58.63 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  58.94 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  54.72 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  55.47 
 
 		 250 aa  265  8e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  55.06 
 
 		 301 aa  263  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  54.03 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  54.22 
 
 		 254 aa  261  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  55.56 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  51.41 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  58 
 
 		 256 aa  254  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  56.85 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  53.23 
 
 		 250 aa  252  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  56.15 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  51.01 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 		 255 aa  248  8e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 		 255 aa  248  8e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  51.98 
 
 		 299 aa  248  8e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  49.01 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 254 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  44.98 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 		 257 aa  242  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  48.8 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  46.18 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  46.18 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  46.59 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  52.05 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 		 256 aa  238  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  47.24 
 
 		 254 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  45.78 
 
 		 253 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  50.61 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 274 aa  235  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  45.78 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  51.23 
 
 		 259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  43.85 
 
 		 255 aa  235  6e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 249 aa  235  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  48.78 
 
 		 253 aa  234  8e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  45.24 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  45.24 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  44.98 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  45.42 
 
 		 252 aa  232  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  47.15 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 273 aa  231  7.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  50.4 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  47.77 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  45.9 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  48.78 
 
 		 246 aa  228  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  46.75 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 		 255 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  47.95 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  48.21 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  47.97 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  49.59 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  47.15 
 
 		 250 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  48.97 
 
 		 251 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  47.98 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0027  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.529091  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  45.42 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  48.98 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 		 244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  48.02 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 		 256 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  47.39 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  47.56 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  44.8 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1572  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>