225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5927 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 252 aa  492  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  64.4 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  59.04 
 
 		 252 aa  292  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  62.3 
 
 		 254 aa  290  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  65.73 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  64.26 
 
 		 254 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  65.2 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  59.27 
 
 		 252 aa  275  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  59.84 
 
 		 254 aa  274  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  59.84 
 
 		 254 aa  274  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  59.84 
 
 		 254 aa  274  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  62.25 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  58.06 
 
 		 253 aa  271  6e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  56.8 
 
 		 254 aa  271  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  62.96 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  62.15 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  59.68 
 
 		 249 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  58.17 
 
 		 255 aa  259  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  60 
 
 		 251 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  60.08 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  52.61 
 
 		 256 aa  254  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  57.2 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  59.04 
 
 		 252 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  55.14 
 
 		 250 aa  251  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  59.68 
 
 		 249 aa  251  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  55.92 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  53.78 
 
 		 252 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  55.33 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  52.05 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  48.21 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  55.24 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  57.6 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  57.32 
 
 		 299 aa  230  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  53.2 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  53.88 
 
 		 257 aa  228  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  47.41 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29760  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  55.56 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  48 
 
 		 257 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  51.64 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  51.64 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  48.56 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  40.65 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  48.77 
 
 		 274 aa  215  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  47.81 
 
 		 254 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  47.97 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  44.72 
 
 		 255 aa  208  8e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  46.46 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  42.86 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  47.2 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  48.16 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  41.8 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  48.15 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 256 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  44.9 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  47.54 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  41.56 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  41.22 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  48.22 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  37.8 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  47.54 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  41.95 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  40.41 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  41.95 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  45.6 
 
 		 273 aa  198  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  40.82 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  40.41 
 
 		 253 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  44.49 
 
 		 246 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0716  LamB/YcsF family protein  41.49 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0495612  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  45.75 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  44.49 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  42.68 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  38.62 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  38.62 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  39.59 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  41.53 
 
 		 253 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  47.54 
 
 		 261 aa  194  8.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2920  hypothetical protein  45.12 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2862  hypothetical protein  45.53 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.477951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1497  LamB/YcsF family protein  48.78 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  40.41 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  37.8 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2722  hypothetical protein  45.56 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  45.08 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>