225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1269 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 255 aa  520  1e-146  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  54.72 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  54.72 
 
 		 255 aa  299  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  53.94 
 
 		 255 aa  297  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  52.57 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  51.2 
 
 		 251 aa  274  8e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 253 aa  262  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  47.62 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  49.17 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  46.56 
 
 		 250 aa  255  5e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  45.78 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  50.8 
 
 		 250 aa  255  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  50.8 
 
 		 250 aa  255  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 254 aa  254  9e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  49.21 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  47.64 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  50.4 
 
 		 254 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 		 253 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 253 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  50 
 
 		 251 aa  247  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  45.6 
 
 		 252 aa  244  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 		 253 aa  244  9e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 		 253 aa  244  9e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 		 251 aa  242  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 		 257 aa  242  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 253 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  45.06 
 
 		 254 aa  239  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  44.84 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  46.12 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 254 aa  238  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 246 aa  238  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  44.66 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  44.66 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  44.66 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  44.66 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 		 255 aa  238  9e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  44.66 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  43.78 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  44.9 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  48.58 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  44.66 
 
 		 254 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  44.98 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 		 250 aa  235  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  45 
 
 		 252 aa  235  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  43.85 
 
 		 255 aa  235  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 		 250 aa  234  7e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  43.03 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 		 254 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  42.63 
 
 		 250 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 		 247 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  44.49 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  45.64 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  47.97 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  44.27 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  44.27 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  44.9 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  45.42 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  47.92 
 
 		 256 aa  228  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  44.27 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  44.27 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  46.44 
 
 		 264 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  44.27 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  47.98 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4034  LamB/YcsF family protein  42.58 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  42.17 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0716  LamB/YcsF family protein  41.74 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0495612  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  44.77 
 
 		 242 aa  220  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  42.45 
 
 		 252 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  42.91 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  45.08 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  45.08 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05795  LamB/YcsF family protein  42.5 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  45.08 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  44.09 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  45.61 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  42.29 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  40.65 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  42.91 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  44.4 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  44.62 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  41.37 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  40.96 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  41.37 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0807  hypothetical protein  42.39 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>