225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1980 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 259 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  62.8 
 
 		 273 aa  312  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  52.59 
 
 		 255 aa  252  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  57.37 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  51.81 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  50.8 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  48.61 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  50.59 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 		 255 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  48 
 
 		 254 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  46.83 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  45.42 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  48.62 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  49.79 
 
 		 255 aa  231  9e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  46.67 
 
 		 274 aa  230  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  47.98 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  46.59 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  48 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  43.95 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  47.41 
 
 		 254 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 		 254 aa  221  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  48.22 
 
 		 299 aa  221  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 		 262 aa  221  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1386  LamB/YcsF family protein  49.41 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.624042 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1497  LamB/YcsF family protein  52.61 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  45.67 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  45.28 
 
 		 256 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  47.22 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  42.17 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  42.17 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2055  LamB/YcsF family protein  48 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  46 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  46 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  46 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  42.68 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  48.21 
 
 		 257 aa  215  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  45.6 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  45.53 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7659  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  41.37 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  47.81 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  46.18 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  46.43 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  46.75 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  47.01 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 		 264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  44.98 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 		 252 aa  211  9e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  47.2 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  46.75 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  41.87 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  44.27 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2131  LamB/YcsF family protein  54.18 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  41.3 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 		 249 aa  208  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 		 250 aa  208  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  47.39 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2226  LamB/YcsF family protein  41.46 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  42.34 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  45.42 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  46.25 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  44.62 
 
 		 257 aa  205  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6367  LamB/YcsF family protein  46.67 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.826752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  39.44 
 
 		 257 aa  201  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  41.37 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  45.56 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  40.4 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  44.8 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  39.6 
 
 		 253 aa  198  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  43.5 
 
 		 246 aa  198  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  40 
 
 		 253 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  40.4 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4552  LamB/YcsF family protein  45 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.152048 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  40 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  45.78 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>