225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0608 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 253 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  60.08 
 
 		 252 aa  309  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  62.9 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  58.87 
 
 		 252 aa  297  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  60.71 
 
 		 254 aa  291  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  61.29 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  60.64 
 
 		 254 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  60.64 
 
 		 254 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  60.64 
 
 		 254 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  60.71 
 
 		 254 aa  283  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  58.23 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  60.64 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  58.96 
 
 		 257 aa  280  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  57.03 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  54.84 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  57.26 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  58.43 
 
 		 258 aa  275  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  54.84 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  56.35 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  59.76 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  58.06 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  60.32 
 
 		 253 aa  271  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  59.04 
 
 		 251 aa  271  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  58.63 
 
 		 301 aa  270  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  56 
 
 		 252 aa  267  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  53.17 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  57.2 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  56.91 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  54.84 
 
 		 252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  58.23 
 
 		 252 aa  258  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  54.22 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  56.45 
 
 		 304 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  54.62 
 
 		 249 aa  244  6.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  54 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  48.02 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 		 249 aa  238  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  54.84 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  51.41 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  45.64 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  48.41 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  47.83 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  42.86 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  45.42 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  45.28 
 
 		 257 aa  218  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  46 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  43.09 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  43.09 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  46.59 
 
 		 274 aa  215  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  46.94 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  48.61 
 
 		 255 aa  215  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 		 250 aa  214  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  46.61 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  42.92 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  47.76 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0807  hypothetical protein  45.31 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  42.28 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  45.85 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  45.85 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  41.87 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29760  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  52 
 
 		 255 aa  211  5.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  47.39 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  43.59 
 
 		 252 aa  211  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  41.87 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  42.5 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  46.91 
 
 		 251 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  42.5 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  45.68 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  46.59 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3547  LamB/YcsF family protein  45.04 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  41.53 
 
 		 253 aa  208  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  44.9 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  41.91 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  45.87 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  45.93 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  46.12 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  45.93 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  45.93 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  46.12 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  45.93 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  46.12 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  46.61 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  39.84 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  46.61 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  39.84 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  39.84 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3378  LamB/YcsF family protein  44.67 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  0.571628 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  46.34 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  46.34 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  45.63 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>