225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2827 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2827  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 245 aa  481  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  hitchhiker  0.00875882 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  58.85 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  58.44 
 
 		 244 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  58.44 
 
 		 244 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  58.02 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  58.02 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  58.02 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  58.02 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  58.02 
 
 		 244 aa  269  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  57.96 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0803  LamB/YcsF family protein  57.61 
 
 		 244 aa  268  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.179932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1138  LamB/YcsF family protein  54.96 
 
 		 245 aa  258  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  56.28 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  54.32 
 
 		 245 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  54.32 
 
 		 245 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  54.32 
 
 		 245 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  55.87 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  55.47 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0871  LamB/YcsF family protein  53.5 
 
 		 244 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0761  LamB/YcsF family protein  53.5 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0822  LamB/YcsF family protein  53.09 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0506032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0774  LamB/YcsF family protein  53.09 
 
 		 244 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.846244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  53.85 
 
 		 250 aa  248  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0837  LamB/YcsF family protein  53.09 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  54.69 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  53.31 
 
 		 245 aa  245  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  55.1 
 
 		 246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1228  LamB/YcsF family protein  51.24 
 
 		 245 aa  244  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  53.04 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  55.2 
 
 		 256 aa  242  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  53.39 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  47.01 
 
 		 253 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  52.02 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  47.01 
 
 		 253 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  53.5 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  52.23 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  52.65 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  52.89 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  52.24 
 
 		 254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  52.24 
 
 		 254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  52.24 
 
 		 254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  52.24 
 
 		 254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  47.41 
 
 		 253 aa  234  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  52.65 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  54.55 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  47.01 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  53.09 
 
 		 254 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 254 aa  231  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  53.06 
 
 		 254 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  53.06 
 
 		 254 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  46.18 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 253 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2920  LamB/YcsF family protein  53.72 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  52.65 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  52.65 
 
 		 254 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  52.65 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  45.82 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  45.82 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  44.62 
 
 		 253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  46 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0027  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.529091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3108  LamB/YcsF family protein  50.83 
 
 		 245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  42.69 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  47.64 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2226  LamB/YcsF family protein  44.03 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  47.04 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  47.81 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  45.19 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0006  LamB/YcsF family protein  47.86 
 
 		 242 aa  211  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0021  hypothetical protein  45.61 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312119 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  47.39 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  44 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  44 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  46.48 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  46.83 
 
 		 256 aa  207  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  47.22 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  47.37 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1803  LamB/YcsF  48.58 
 
 		 248 aa  205  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.372546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0008  LamB/YcsF family protein  42.98 
 
 		 246 aa  204  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000119793 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0010  LamB/YcsF family protein  45.76 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1098  LamB/YcsF family protein  42.15 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.248626  normal  0.159804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  48.61 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  45.82 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  51.81 
 
 		 260 aa  198  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  48.62 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  43.82 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4381  LamB/YcsF family protein  42.56 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284094  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  48.21 
 
 		 254 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 		 256 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  42.86 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  43.27 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 		 252 aa  191  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  50.81 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  44.05 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  38.25 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  47.81 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>