225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2788 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  100 
 
 
251 aa  503  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  55.51 
 
 
251 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  57.83 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  52.23 
 
 
250 aa  271  8.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  52.23 
 
 
250 aa  271  8.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  51.41 
 
 
253 aa  265  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  51.41 
 
 
253 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  51.41 
 
 
253 aa  264  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 
253 aa  261  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 
253 aa  261  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 
252 aa  259  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 
253 aa  259  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
255 aa  259  3e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 
253 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  54.8 
 
 
274 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 
253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 
254 aa  256  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 
253 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 
254 aa  254  8e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  51.84 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 
250 aa  249  4e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 
255 aa  248  6e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 
255 aa  247  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 
255 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 
258 aa  245  4e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  48.58 
 
 
256 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  51.41 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  55.28 
 
 
260 aa  242  5e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  51.81 
 
 
247 aa  242  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  52.02 
 
 
250 aa  241  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  52.44 
 
 
246 aa  240  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  49.79 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 
252 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  52.03 
 
 
245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
250 aa  235  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 
250 aa  234  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  51.02 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  51.02 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  51.02 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  51.02 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  51.02 
 
 
262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  47.39 
 
 
254 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  51.02 
 
 
254 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  51.02 
 
 
254 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  51.84 
 
 
254 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 
245 aa  231  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 
264 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  50.81 
 
 
250 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 
255 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 
244 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 
257 aa  228  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 
244 aa  227  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  48.98 
 
 
245 aa  226  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  48.98 
 
 
245 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  48.98 
 
 
245 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  51.71 
 
 
244 aa  225  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  51.71 
 
 
244 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  51.71 
 
 
244 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  53.42 
 
 
262 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  51.71 
 
 
244 aa  225  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  51.71 
 
 
244 aa  225  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  51.84 
 
 
254 aa  224  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  51.28 
 
 
244 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 
255 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 
246 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0822  LamB/YcsF family protein  50.85 
 
 
244 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0506032  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0803  LamB/YcsF family protein  48.98 
 
 
244 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.179932  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  48.78 
 
 
246 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 
254 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 
254 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 
254 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  51.43 
 
 
254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0871  LamB/YcsF family protein  50.85 
 
 
244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  51.43 
 
 
254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 
254 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  51.43 
 
 
254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  45.71 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  50.8 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  51.43 
 
 
254 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  51.43 
 
 
274 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0761  LamB/YcsF family protein  50.43 
 
 
244 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  51.43 
 
 
274 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  43.6 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  48.57 
 
 
253 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0774  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
244 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.846244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0837  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
244 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000610355 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  45.2 
 
 
255 aa  217  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  51 
 
 
252 aa  217  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 
254 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  45.6 
 
 
257 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 
256 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  42.91 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 
251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1138  LamB/YcsF family protein  46.34 
 
 
245 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0027  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 
247 aa  209  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.529091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 
255 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  41.2 
 
 
254 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0361  LamB/YcsF family protein  42.24 
 
 
256 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.135278  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>