225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2043 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 256 aa  520  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  92.16 
 
 		 256 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  90.98 
 
 		 256 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  86.67 
 
 		 256 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  54.55 
 
 		 257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  56 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  52.99 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  53.97 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 255 aa  263  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  53.97 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  52.4 
 
 		 255 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  53.36 
 
 		 256 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  50.59 
 
 		 255 aa  249  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 258 aa  248  5e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  48.83 
 
 		 255 aa  241  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  50.99 
 
 		 274 aa  240  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  50 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  46.18 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  50 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  48 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  47.39 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  48.18 
 
 		 253 aa  231  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  48.41 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  47.81 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1386  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.624042 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 		 251 aa  228  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  42.51 
 
 		 255 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  42.51 
 
 		 255 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  42.57 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  48.03 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 		 254 aa  225  7e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  46.4 
 
 		 256 aa  224  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  48.81 
 
 		 262 aa  222  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  44.84 
 
 		 255 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1497  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 251 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  44.44 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  45.85 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  48.18 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  44.53 
 
 		 254 aa  218  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  45.63 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  45.85 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  48.62 
 
 		 253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  46.06 
 
 		 254 aa  215  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 		 252 aa  214  7e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  47.43 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  44.98 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  42.4 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  46.61 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  42.57 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  45.82 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 252 aa  209  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  43.97 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  47.2 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  41.11 
 
 		 252 aa  208  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2055  LamB/YcsF family protein  46.25 
 
 		 257 aa  208  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  46.96 
 
 		 244 aa  208  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  41.6 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  41.6 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  45.2 
 
 		 254 aa  208  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  46.96 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  45.67 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0871  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 		 244 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  43.6 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0822  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 		 244 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0506032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0803  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.179932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0774  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.846244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0761  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 		 244 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  44.4 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  46.06 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  46.15 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  46.15 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 		 244 aa  202  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 		 244 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1723  hypothetical protein  44.58 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  42.29 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  42.29 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0274  hypothetical protein  44.58 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0837  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>