225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1341 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  89.02 
 
 		 255 aa  474  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  51.56 
 
 		 257 aa  261  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  51.41 
 
 		 256 aa  249  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 		 274 aa  241  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 256 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  49.41 
 
 		 262 aa  240  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  48.8 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  47.81 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  47.98 
 
 		 255 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 255 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 257 aa  236  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 260 aa  235  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  47.81 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  45.45 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  48 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  48.61 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  38.58 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  38.58 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  43.2 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  40.8 
 
 		 252 aa  218  7e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  37.8 
 
 		 255 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  41.9 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 		 258 aa  215  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  44.9 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  42.28 
 
 		 254 aa  215  7e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  41.6 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  41.34 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  41.6 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  44.44 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  42.5 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  43.92 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1386  LamB/YcsF family protein  43.25 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.624042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  39.27 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2131  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  41.13 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  42.46 
 
 		 261 aa  202  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  38.87 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  41.94 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  38.46 
 
 		 253 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  43.6 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  43.27 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  46.91 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2055  LamB/YcsF family protein  44.49 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  44.8 
 
 		 254 aa  198  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  38.87 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  39.27 
 
 		 254 aa  198  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  42.57 
 
 		 253 aa  198  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  38.46 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  38.46 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  38.46 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  41.6 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  42.46 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  39.27 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  40 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  40.32 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  42.91 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  42.04 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  44.31 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  37.65 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5865  hypothetical protein  41.63 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1497  LamB/YcsF family protein  43.6 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  42.86 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  42.45 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1497  LamB/YcsF family protein  40.82 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.910801  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  38.71 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  41.3 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4034  LamB/YcsF family protein  39.29 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  40.49 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  42.86 
 
 		 256 aa  184  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  43.67 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  42.45 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  40.89 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1736  LamB/YcsF family protein  38.84 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05795  LamB/YcsF family protein  37.55 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  40.89 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1436  LamB/YcsF family protein  37.76 
 
 		 246 aa  181  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  40.49 
 
 		 251 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  39.52 
 
 		 245 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2722  hypothetical protein  42.97 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>