225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5814 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  57.14 
 
 		 254 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  56.18 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  56 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  55.78 
 
 		 256 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  53.78 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  59.36 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  59.36 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  56.4 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  54.58 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  55.95 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  55.16 
 
 		 254 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  57.37 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  53.01 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  56.68 
 
 		 258 aa  268  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  52.99 
 
 		 255 aa  263  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  51.56 
 
 		 255 aa  261  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  49.61 
 
 		 255 aa  255  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  51.81 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  53.01 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1386  LamB/YcsF family protein  50.79 
 
 		 266 aa  241  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.624042 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  47.83 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  47.22 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  44.72 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  44.72 
 
 		 255 aa  237  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  43.9 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  50.79 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  47.01 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  51.41 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2055  LamB/YcsF family protein  51.82 
 
 		 257 aa  224  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  47.43 
 
 		 256 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  48.41 
 
 		 251 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  48.43 
 
 		 261 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2131  LamB/YcsF family protein  53.82 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  46.48 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  46.18 
 
 		 274 aa  218  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  50.39 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  43.75 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  46.4 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  41.18 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  48.16 
 
 		 254 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 253 aa  211  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  45.93 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  47.43 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  46.83 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  51.84 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  41.94 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2592  LamB/YcsF family protein  45.49 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  43.32 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  40.08 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 		 273 aa  205  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  43.63 
 
 		 258 aa  205  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  47.22 
 
 		 252 aa  204  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  39.68 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 		 301 aa  203  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  41.1 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  41.1 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  40.68 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  40.68 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  39.68 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  45.42 
 
 		 256 aa  201  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  42.17 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  45.38 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  40.56 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  43.78 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1497  LamB/YcsF family protein  50 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  40.08 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 		 254 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  46.59 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  45.82 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  43.22 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7659  LamB/YcsF family protein  43.19 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  41.39 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  46.18 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  38.46 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  42.68 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  47.01 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  43.15 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  44.62 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  43.15 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  42.17 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>