225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4561 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 260 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  97.31 
 
 		 260 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  88.89 
 
 		 255 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  59.36 
 
 		 257 aa  289  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  54.22 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  56.57 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  57.66 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  57.03 
 
 		 258 aa  268  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  56.97 
 
 		 254 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  52.99 
 
 		 257 aa  268  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  56 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  56.18 
 
 		 254 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  56.5 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  51.18 
 
 		 256 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  51.18 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  55.42 
 
 		 251 aa  254  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  58.47 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 256 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  53.01 
 
 		 255 aa  249  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  52.02 
 
 		 256 aa  248  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1386  LamB/YcsF family protein  53.97 
 
 		 266 aa  247  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.624042 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2055  LamB/YcsF family protein  52.59 
 
 		 257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  50.4 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  49.01 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  51.19 
 
 		 256 aa  232  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  48.25 
 
 		 274 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  52.89 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  48.15 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 		 257 aa  228  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  46.61 
 
 		 256 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 250 aa  225  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  49.21 
 
 		 254 aa  225  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  50.39 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  50.39 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  50.39 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  46.27 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2131  LamB/YcsF family protein  58.87 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1497  LamB/YcsF family protein  54.4 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  47.98 
 
 		 255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  47.39 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  43.57 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  43.57 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 253 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  45.19 
 
 		 254 aa  219  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  51 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  43.78 
 
 		 253 aa  214  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  51 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  43.78 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  50 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  52.94 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  42.57 
 
 		 253 aa  211  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  45.6 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7659  LamB/YcsF family protein  43.9 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  43.09 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  43.82 
 
 		 254 aa  208  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  49.21 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  40.16 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  49.6 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  48.22 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  49.6 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  47.27 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  47.54 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  48.12 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  46.75 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  46.75 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  46.75 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  47.62 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  45.68 
 
 		 253 aa  204  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  46.86 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2592  LamB/YcsF family protein  43.55 
 
 		 256 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  46.72 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  46.86 
 
 		 244 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  46.86 
 
 		 244 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  46.86 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  47.95 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>