225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2118 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2920  hypothetical protein  93.25 
 
 		 252 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2862  hypothetical protein  92.06 
 
 		 252 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.477951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2772  hypothetical protein  91.67 
 
 		 252 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  85.14 
 
 		 251 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2722  hypothetical protein  81.53 
 
 		 251 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06420  hypothetical protein  75 
 
 		 252 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0595  hypothetical protein  74.21 
 
 		 252 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0005  hypothetical protein  73.88 
 
 		 270 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4577  hypothetical protein  69.23 
 
 		 277 aa  349  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00594696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2385  hypothetical protein  65.32 
 
 		 264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1723  hypothetical protein  66.4 
 
 		 266 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0366  hypothetical protein  66.4 
 
 		 266 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0274  hypothetical protein  66.4 
 
 		 266 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1880  hypothetical protein  66 
 
 		 266 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0893  hypothetical protein  66 
 
 		 266 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1179  hypothetical protein  66 
 
 		 266 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2156  hypothetical protein  66 
 
 		 266 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0130  hypothetical protein  63.97 
 
 		 275 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2481  hypothetical protein  62.1 
 
 		 260 aa  333  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0369  hypothetical protein  66.14 
 
 		 260 aa  322  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.244738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6280  hypothetical protein  65.74 
 
 		 260 aa  322  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2951  hypothetical protein  65.74 
 
 		 260 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3259  hypothetical protein  55.87 
 
 		 259 aa  299  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.990579  normal  0.190994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2435  hypothetical protein  55.24 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5865  hypothetical protein  54.44 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  45.42 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  43.65 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 304 aa  215  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  45.63 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  42.69 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  43.55 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  46.37 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  39.04 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  40 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  40 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  40 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  41.96 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  41.04 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  39.61 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  41.37 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  38.65 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  44 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7659  LamB/YcsF family protein  43.82 
 
 		 255 aa  201  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  42.34 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  40 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  40.73 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  39.22 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  42.8 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  39.61 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  42.8 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  43.78 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  42.06 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  43.78 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  45.1 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  38.87 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4034  LamB/YcsF family protein  41.27 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1572  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  38.82 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  42.46 
 
 		 299 aa  194  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  42.86 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  38.04 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  38.04 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  40.49 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  41.6 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  44.09 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  43.27 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  41.2 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  40.48 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  40.32 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  42.97 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  38.25 
 
 		 255 aa  190  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  37.85 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  38.25 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  44.08 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  42.06 
 
 		 258 aa  189  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2592  LamB/YcsF family protein  41.53 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  39.52 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  39.36 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  41.83 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  42.57 
 
 		 260 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  39.27 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  40.4 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  43.15 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 		 249 aa  185  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6367  LamB/YcsF family protein  44.21 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.826752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  40.96 
 
 		 254 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  40.96 
 
 		 254 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  40.96 
 
 		 254 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  42.57 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  40.49 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  44.08 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  39.68 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  43.43 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>