225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5125 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  93.63 
 
 		 251 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0807  hypothetical protein  81.56 
 
 		 247 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12450  hypothetical protein  79.44 
 
 		 250 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.858403  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  61.38 
 
 		 259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  61.89 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  60.63 
 
 		 258 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  60.63 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3378  LamB/YcsF family protein  61.07 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  0.571628 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  62.14 
 
 		 250 aa  295  6e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  58.92 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0716  LamB/YcsF family protein  55.51 
 
 		 246 aa  281  8.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0495612  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3199  LamB/YcsF family protein  61.83 
 
 		 247 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37270  LamB/YcsF family protein  61.41 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000305457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05795  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 251 aa  261  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  51.04 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3547  LamB/YcsF family protein  51.05 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000162  lactam utilization protein LAMB  48.79 
 
 		 251 aa  254  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.078695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1497  LamB/YcsF family protein  52.7 
 
 		 246 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.910801  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0361  LamB/YcsF family protein  47.93 
 
 		 256 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.135278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1983  LamB/YcsF family protein  48.54 
 
 		 241 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1436  LamB/YcsF family protein  45.61 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1736  LamB/YcsF family protein  43.7 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01080  LamB/YcsF family protein  47.54 
 
 		 245 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  49.58 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  48.56 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  47.06 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  46.89 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  50.21 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 		 258 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  48.12 
 
 		 253 aa  212  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  47.11 
 
 		 264 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  43.04 
 
 		 253 aa  211  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  48.95 
 
 		 301 aa  211  7.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  46.91 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  43.04 
 
 		 253 aa  211  9e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  43.04 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  48.97 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  47.3 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  45.27 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  42.19 
 
 		 254 aa  208  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  42.19 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  44.16 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  47.3 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  42.26 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  47.72 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  47.48 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  48.67 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  39.75 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  44.96 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  45.04 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  43.98 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  49.17 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  45.61 
 
 		 249 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  48.03 
 
 		 255 aa  197  9e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  47.33 
 
 		 254 aa  198  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  45.87 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  41 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  41 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  40.59 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  48.77 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  45.83 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  45.08 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  42.98 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1572  LamB/YcsF family protein  48.75 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  41.74 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  45.04 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  41.35 
 
 		 252 aa  191  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  43.39 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  46.72 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  41.42 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0545  LamB/YcsF family protein  43.39 
 
 		 243 aa  188  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000543397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  45.19 
 
 		 249 aa  188  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  44.21 
 
 		 254 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  43.62 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  43.1 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  40.83 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  45.19 
 
 		 252 aa  185  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  38.91 
 
 		 250 aa  185  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  38.91 
 
 		 250 aa  185  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  38.59 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  45.49 
 
 		 253 aa  184  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  47.33 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  43.93 
 
 		 304 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  42.98 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  43.67 
 
 		 254 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  43.67 
 
 		 254 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  43.67 
 
 		 254 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29760  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  45.11 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  40.98 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  44.77 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  41.94 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  40.91 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>