225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1983 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1983  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 241 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3378  LamB/YcsF family protein  55.23 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  0.571628 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01080  LamB/YcsF family protein  53.88 
 
 		 245 aa  271  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0361  LamB/YcsF family protein  51.45 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.135278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  54.39 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  52.32 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  53.56 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  53.33 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  51.48 
 
 		 250 aa  263  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  53.14 
 
 		 258 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  50 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3199  LamB/YcsF family protein  55.65 
 
 		 247 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37270  LamB/YcsF family protein  55.23 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000305457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1497  LamB/YcsF family protein  52.7 
 
 		 246 aa  252  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.910801  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0716  LamB/YcsF family protein  51.04 
 
 		 246 aa  252  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0495612  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05795  LamB/YcsF family protein  52.3 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000162  lactam utilization protein LAMB  48.55 
 
 		 251 aa  242  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.078695  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3547  LamB/YcsF family protein  49.59 
 
 		 243 aa  238  9e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1436  LamB/YcsF family protein  48.13 
 
 		 246 aa  237  9e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  48.54 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12450  hypothetical protein  48.54 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.858403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0807  hypothetical protein  50.42 
 
 		 247 aa  232  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  47.92 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1736  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  41.91 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  42.19 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  42.19 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  42.19 
 
 		 253 aa  214  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  44.77 
 
 		 255 aa  212  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  44.77 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  46.44 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 		 254 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 		 253 aa  211  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  41.08 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  45.04 
 
 		 256 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  41.84 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  42.98 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  40.66 
 
 		 250 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  44.21 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  43.98 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  42.32 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  42.56 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  42.15 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  42.15 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  41.6 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  41 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  41.08 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  41.08 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  41.56 
 
 		 255 aa  194  8.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  40.78 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  42.29 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  41.74 
 
 		 254 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  43.57 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  41.81 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  42.15 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  43.57 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  42.15 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  39.83 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  42.98 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  44.74 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  40.08 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  39.83 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  42.26 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  41.85 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  40.83 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  40.5 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  40.09 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  40.76 
 
 		 260 aa  181  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  39.75 
 
 		 256 aa  181  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  39 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  40.91 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  40.91 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  40.59 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  41.56 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  40.5 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  41.32 
 
 		 255 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  39.67 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  40.97 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  40.5 
 
 		 252 aa  178  5.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  39.42 
 
 		 251 aa  178  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  38.17 
 
 		 250 aa  178  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  42.32 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  40.17 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0005  hypothetical protein  41.25 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0545  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000543397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  41.15 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  38.31 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  44.49 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  38.43 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  38.17 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 		 250 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  38.43 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  39.09 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  39.09 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  39.09 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>