225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0545 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0545  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 243 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000543397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  46.28 
 
 		 258 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  45.87 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  44.86 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  44.17 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  44.21 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01080  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0807  hypothetical protein  43.39 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0008  LamB/YcsF family protein  44.64 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000119793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3199  LamB/YcsF family protein  44.4 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0006  LamB/YcsF family protein  43.04 
 
 		 242 aa  189  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  43.39 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3378  LamB/YcsF family protein  41.32 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  0.571628 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  41.22 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37270  LamB/YcsF family protein  43.57 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000305457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0010  LamB/YcsF family protein  43.28 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3547  LamB/YcsF family protein  43.04 
 
 		 243 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1736  LamB/YcsF family protein  40.6 
 
 		 242 aa  185  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0716  LamB/YcsF family protein  40.66 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0495612  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  40.83 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1983  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0361  LamB/YcsF family protein  39.34 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.135278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12450  hypothetical protein  41.32 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.858403  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1497  LamB/YcsF family protein  43.98 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.910801  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0021  hypothetical protein  41.25 
 
 		 241 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312119 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  38.82 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  38.49 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  37.55 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4381  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  38.4 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  37.97 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  37.97 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  38.08 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  38.66 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1436  LamB/YcsF family protein  36.18 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05795  LamB/YcsF family protein  36.21 
 
 		 251 aa  162  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  36.13 
 
 		 250 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1138  LamB/YcsF family protein  36.71 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  35.98 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  35.98 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  38.08 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  35.98 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  35.98 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  35.98 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  35.98 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  35.98 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  35.98 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  35.71 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  35.71 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  35.71 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2920  LamB/YcsF family protein  37.97 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  37.66 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  36.13 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0871  LamB/YcsF family protein  37.24 
 
 		 244 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  37.97 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  35.39 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  37.97 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  36.36 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  38.27 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  37.97 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  37.97 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  35.95 
 
 		 253 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  37.97 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  37.97 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0761  LamB/YcsF family protein  38.11 
 
 		 244 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  38.1 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  36.84 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1228  LamB/YcsF family protein  34.89 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0774  LamB/YcsF family protein  37.7 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.846244 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000162  lactam utilization protein LAMB  35.68 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.078695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  35.15 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0803  LamB/YcsF family protein  37.87 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.179932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  35.27 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  38.3 
 
 		 244 aa  154  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  35.95 
 
 		 254 aa  154  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  36.29 
 
 		 245 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0837  LamB/YcsF family protein  37.7 
 
 		 244 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  36.4 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  35.98 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  36.61 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  35.98 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0027  LamB/YcsF family protein  37.39 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.529091  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  34.44 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  35.98 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0822  LamB/YcsF family protein  37.3 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0506032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  35.15 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  35.15 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  37.13 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  37.04 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  35.54 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  37.34 
 
 		 252 aa  151  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  35.98 
 
 		 245 aa  151  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  37.19 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  37.71 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  35.66 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3108  LamB/YcsF family protein  34.33 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  36.93 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08921  hypothetical protein  36.09 
 
 		 248 aa  148  9e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  34.44 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>