225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0807 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0807  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  490  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  81.56 
 
 		 251 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  80.41 
 
 		 251 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12450  hypothetical protein  80.89 
 
 		 250 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.858403  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  60.32 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  59.51 
 
 		 259 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  58.7 
 
 		 259 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3378  LamB/YcsF family protein  58.7 
 
 		 249 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  0.571628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  59.51 
 
 		 258 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  56.33 
 
 		 250 aa  288  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0716  LamB/YcsF family protein  56.61 
 
 		 246 aa  287  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0495612  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3199  LamB/YcsF family protein  61.38 
 
 		 247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37270  LamB/YcsF family protein  61.38 
 
 		 247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000305457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  59.26 
 
 		 250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05795  LamB/YcsF family protein  48.76 
 
 		 251 aa  262  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  49.79 
 
 		 242 aa  257  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000162  lactam utilization protein LAMB  47.95 
 
 		 251 aa  250  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.078695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1497  LamB/YcsF family protein  52.3 
 
 		 246 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.910801  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3547  LamB/YcsF family protein  50.64 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0361  LamB/YcsF family protein  45.45 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.135278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1983  LamB/YcsF family protein  50.42 
 
 		 241 aa  232  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1436  LamB/YcsF family protein  45.61 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1736  LamB/YcsF family protein  44.49 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  50 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  45.93 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  45.49 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  42.39 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  49.37 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  42.08 
 
 		 253 aa  215  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  41.67 
 
 		 253 aa  214  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  41.25 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  45.87 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  41.67 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  41.25 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  41.25 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  47.7 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  43.16 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  40.83 
 
 		 254 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  46.89 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  46.72 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  46.12 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  41.25 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01080  LamB/YcsF family protein  44.67 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  44.9 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  41.25 
 
 		 253 aa  209  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  44.08 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  40.98 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  40.98 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  40.41 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  48.03 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  44.81 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  46.89 
 
 		 249 aa  202  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  45.49 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  43.21 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  44.21 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  45.64 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  44.49 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  47.54 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  45.45 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  44.17 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  43.03 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  40.34 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  46.31 
 
 		 246 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  44.21 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  41.74 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  43.62 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  42.68 
 
 		 255 aa  194  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  41.67 
 
 		 252 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  41.8 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1572  LamB/YcsF family protein  48.55 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  43.03 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  45.13 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  40.91 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  40.91 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  42.98 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  45.9 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  43.9 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0545  LamB/YcsF family protein  43.39 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000543397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  43.85 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  43.95 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  43.95 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  43.95 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  43.09 
 
 		 304 aa  188  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  41.46 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  38.84 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  40.82 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  45.23 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  41.06 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  41.6 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>