234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3126 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  427  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  43.85 
 
 
206 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  42.7 
 
 
198 aa  164  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.27558e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  42.25 
 
 
198 aa  162  4e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  1.64661e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  40.54 
 
 
198 aa  157  9e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  42.19 
 
 
201 aa  149  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  38.82 
 
 
198 aa  140  2e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  39.56 
 
 
290 aa  136  3e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  37.88 
 
 
204 aa  134  7e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  40.37 
 
 
205 aa  134  1e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  40.7 
 
 
201 aa  134  1e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  47.37 
 
 
213 aa  133  2e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  41.86 
 
 
204 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  37.37 
 
 
203 aa  131  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  37.37 
 
 
203 aa  131  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  37.37 
 
 
203 aa  131  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.725e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  39.38 
 
 
219 aa  130  1e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  41.85 
 
 
212 aa  130  1e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  40.56 
 
 
245 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  36.68 
 
 
203 aa  129  4e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  37.5 
 
 
194 aa  129  4e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  39.53 
 
 
203 aa  128  5e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  38.8 
 
 
195 aa  127  8e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  42.11 
 
 
195 aa  127  9e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  37.5 
 
 
239 aa  127  1e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  41.81 
 
 
218 aa  127  1e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  41.61 
 
 
195 aa  126  2e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  38.86 
 
 
200 aa  126  2e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  43.71 
 
 
197 aa  126  2e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  41.18 
 
 
194 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  39.36 
 
 
195 aa  125  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  41.61 
 
 
195 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  41.61 
 
 
195 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  41.61 
 
 
195 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  36.14 
 
 
204 aa  124  8e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  36.68 
 
 
204 aa  124  8e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  41.61 
 
 
195 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  37 
 
 
204 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  40.48 
 
 
204 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  38.29 
 
 
207 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  35.5 
 
 
206 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  40.91 
 
 
199 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  40 
 
 
194 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  38.89 
 
 
206 aa  122  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  40.72 
 
 
197 aa  120  1e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  40.23 
 
 
222 aa  120  2e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  34.54 
 
 
204 aa  120  2e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.19511e-05  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3648  hypothetical protein  42.94 
 
 
197 aa  119  4e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.987474  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  35.18 
 
 
204 aa  118  5e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  37.71 
 
 
207 aa  119  5e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  38.25 
 
 
209 aa  118  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  35.29 
 
 
205 aa  117  1e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  38.69 
 
 
204 aa  117  1e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  37.21 
 
 
204 aa  117  2e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  34.01 
 
 
204 aa  116  2e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  47.14 
 
 
225 aa  116  2e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  34.52 
 
 
204 aa  116  2e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  34.01 
 
 
204 aa  117  2e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  34.52 
 
 
204 aa  117  2e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  2.52745e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  34.52 
 
 
204 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69816e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  35.35 
 
 
204 aa  115  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  34.67 
 
 
211 aa  115  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  38.89 
 
 
196 aa  114  8e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  38.89 
 
 
196 aa  114  8e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  38.89 
 
 
303 aa  114  1e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  37.24 
 
 
209 aa  114  1e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  38.89 
 
 
303 aa  114  1e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  44.3 
 
 
303 aa  114  1e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  44.3 
 
 
303 aa  114  1e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  40.49 
 
 
195 aa  113  2e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  34.78 
 
 
213 aa  113  2e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  33.5 
 
 
204 aa  112  4e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  33.51 
 
 
204 aa  112  4e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  32.14 
 
 
212 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  36.05 
 
 
176 aa  111  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  46.22 
 
 
207 aa  111  8e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  33.68 
 
 
197 aa  110  1e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  38.38 
 
 
212 aa  110  1e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  43.48 
 
 
242 aa  110  1e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  32.97 
 
 
197 aa  110  2e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3285  protein of unknown function UPF0029  33.69 
 
 
202 aa  110  2e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.897292  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  34.5 
 
 
210 aa  109  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  38.46 
 
 
211 aa  108  4e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.71 
 
 
210 aa  108  4e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  31.87 
 
 
211 aa  108  4e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  34.12 
 
 
211 aa  108  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  38.04 
 
 
208 aa  108  7e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  30.9 
 
 
212 aa  108  8e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  32.28 
 
 
211 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  38.75 
 
 
214 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  35.9 
 
 
211 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  38.2 
 
 
212 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  44.54 
 
 
206 aa  106  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  32.18 
 
 
221 aa  105  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.75512e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  32.26 
 
 
206 aa  105  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  32.64 
 
 
208 aa  105  7e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.97 
 
 
211 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  38.98 
 
 
213 aa  104  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  28.79 
 
 
207 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.70968e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  33.97 
 
 
211 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>