More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2131 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  55.75 
 
 
662 aa  717    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
689 aa  1413    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  54.27 
 
 
636 aa  686    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  44.13 
 
 
648 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  43.78 
 
 
647 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  42.45 
 
 
624 aa  473  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  41.92 
 
 
647 aa  472  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  42.28 
 
 
648 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  42.28 
 
 
648 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  41.95 
 
 
648 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  40.88 
 
 
649 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  42.59 
 
 
628 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  42.49 
 
 
681 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1763  penicillin-binding protein 2  43.21 
 
 
658 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549162  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  43.16 
 
 
670 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  40.93 
 
 
634 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  39.43 
 
 
639 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0497  peptidoglycan glycosyltransferase  39.27 
 
 
634 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  38.05 
 
 
643 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  38.42 
 
 
619 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  37.06 
 
 
639 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  36.83 
 
 
609 aa  362  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  36.42 
 
 
645 aa  362  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  37.22 
 
 
636 aa  359  7e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  36.15 
 
 
647 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  36.27 
 
 
642 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  38.17 
 
 
627 aa  348  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  38.1 
 
 
611 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  36.33 
 
 
630 aa  335  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  36.13 
 
 
640 aa  333  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  36.52 
 
 
636 aa  333  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  36.58 
 
 
662 aa  333  6e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  36.58 
 
 
664 aa  331  3e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  35.71 
 
 
633 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  35.5 
 
 
678 aa  330  8e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  36.24 
 
 
626 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  35.62 
 
 
645 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  34.33 
 
 
643 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  37.19 
 
 
646 aa  327  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.44 
 
 
618 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  36.27 
 
 
646 aa  324  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  36.33 
 
 
626 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 
635 aa  322  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  34.09 
 
 
638 aa  321  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  34.05 
 
 
607 aa  318  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  32.41 
 
 
628 aa  318  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  32.99 
 
 
640 aa  317  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  32.56 
 
 
634 aa  317  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  34.37 
 
 
635 aa  316  8e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  32.05 
 
 
637 aa  316  9.999999999999999e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
646 aa  316  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 
634 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 
602 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 
619 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  33.88 
 
 
632 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  32.41 
 
 
755 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  35.58 
 
 
631 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1347  penicillin-binding protein 2  32.92 
 
 
601 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  33.28 
 
 
652 aa  313  5.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  34.27 
 
 
597 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  34.57 
 
 
602 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  34.57 
 
 
602 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  34.11 
 
 
618 aa  312  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  32.12 
 
 
634 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0680  penicillin-binding protein 2  32.74 
 
 
601 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.104007  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  32.4 
 
 
634 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  34.77 
 
 
630 aa  311  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  36.14 
 
 
631 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 
618 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
646 aa  311  4e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0755  penicillin-binding protein 2  32.74 
 
 
599 aa  310  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0450  penicillin-binding protein 2  33.51 
 
 
609 aa  310  5.9999999999999995e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  36.14 
 
 
631 aa  310  8e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  34.67 
 
 
801 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  34.11 
 
 
618 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  33.83 
 
 
703 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  32.67 
 
 
636 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  33.5 
 
 
637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  33.95 
 
 
618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  33.95 
 
 
618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  35.24 
 
 
632 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  34.62 
 
 
809 aa  308  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  35.98 
 
 
629 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  34.62 
 
 
803 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1995  penicillin-binding protein 2  33.27 
 
 
607 aa  307  3e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.66 
 
 
641 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  34.33 
 
 
630 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  34.31 
 
 
615 aa  307  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  33.98 
 
 
612 aa  307  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  35.02 
 
 
629 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 
683 aa  306  8.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 
618 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  33.67 
 
 
618 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 
618 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  34.5 
 
 
766 aa  306  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 
618 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  34.45 
 
 
803 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  32.88 
 
 
623 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  32.72 
 
 
623 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0309  penicillin-binding protein 2  32.64 
 
 
608 aa  305  3.0000000000000004e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.244318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>