201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4631 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
192 aa  387  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  81.58 
 
 
192 aa  322  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  79.26 
 
 
192 aa  309  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  76.32 
 
 
189 aa  291  5e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.42 
 
 
190 aa  233  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  57.89 
 
 
187 aa  222  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  57.89 
 
 
208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.73 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.49 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.59 
 
 
197 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.27 
 
 
179 aa  98.6  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  34.17 
 
 
198 aa  97.8  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.24 
 
 
224 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.98 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  35.29 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37 
 
 
201 aa  94.4  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.99 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.44 
 
 
181 aa  92  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.16 
 
 
201 aa  91.7  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.76 
 
 
180 aa  91.3  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  36 
 
 
208 aa  91.3  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.82 
 
 
221 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.16 
 
 
201 aa  89  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
221 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.33 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.73 
 
 
219 aa  87  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.68 
 
 
204 aa  87  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.47 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  35.5 
 
 
221 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.5 
 
 
204 aa  85.5  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.12 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.65 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  32.64 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  30.16 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.68 
 
 
204 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  33.72 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  33.68 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.64 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  35.53 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.53 
 
 
217 aa  79  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.34 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  32.95 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.66 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.51 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.66 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  31.79 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  30.7 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  29.08 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.88 
 
 
188 aa  72  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  33.12 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  30.93 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.69 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.19 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.38 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.5 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.88 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  34.16 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.47 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.87 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  27.64 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  30.15 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  29.8 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.92 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.35 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  31.5 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  32.32 
 
 
203 aa  64.3  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.1 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 
199 aa  63.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.06 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.17 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  27.5 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.08 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.02 
 
 
194 aa  62  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.66 
 
 
188 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  28.57 
 
 
185 aa  61.6  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  31.71 
 
 
199 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.6 
 
 
177 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.44 
 
 
176 aa  61.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  31.94 
 
 
208 aa  61.2  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  27.92 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  32 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  30.73 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  30.96 
 
 
214 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.5 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.8 
 
 
187 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.1 
 
 
190 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.5 
 
 
188 aa  58.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  28.08 
 
 
183 aa  58.5  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  31.17 
 
 
179 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  29.21 
 
 
176 aa  58.2  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.06 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 
183 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>