76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1537 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  361  4e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  69.23 
 
 		 186 aa  240  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 179 aa  111  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  27.61 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  29.71 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  26.29 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  26.67 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  21.51 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  25.14 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  22.58 
 
 		 185 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 218 aa  51.2  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  27.63 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  27.63 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  26.79 
 
 		 203 aa  51.2  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  28.26 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  21.51 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  33.7 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  29.14 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  20.97 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  20.97 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  20.83 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  20.83 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  19.77 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  38.16 
 
 		 263 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  26.95 
 
 		 252 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  24.58 
 
 		 232 aa  45.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  29.79 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  26.59 
 
 		 201 aa  45.1  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  39.44 
 
 		 334 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 187 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  22.41 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 240 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  27.82 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  30.95 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  21.9 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  33 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  27.44 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  26.81 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  27.01 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 121 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  26.82 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  30.68 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  18.8 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  40.54 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 186 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 190 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  27.71 
 
 		 176 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 190 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 190 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  37.5 
 
 		 197 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  24.35 
 
 		 208 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  25.45 
 
 		 174 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1971  transcriptional regulator, PadR-like family  30.53 
 
 		 114 aa  41.6  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 152 aa  41.2  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  31.71 
 
 		 206 aa  41.2  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  27.08 
 
 		 255 aa  40.8  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>