116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0513 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  100 
 
 		 95 aa  190  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3447  chorismate mutase  75 
 
 		 94 aa  141  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734851  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  73.56 
 
 		 111 aa  135  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  74.12 
 
 		 106 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4074  chorismate mutase  71.59 
 
 		 106 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  70.45 
 
 		 96 aa  130  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  67.39 
 
 		 103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4204  chorismate mutase  67.39 
 
 		 110 aa  127  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47894  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0060  chorismate mutase  68.13 
 
 		 114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  hitchhiker  0.00833168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  63.33 
 
 		 110 aa  123  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0631  chorismate mutase  63.22 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0652  chorismate mutase  63.22 
 
 		 115 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0670145  normal  0.113986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0663  chorismate mutase  63.22 
 
 		 115 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  66.28 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1396  chorismate mutase  63.04 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  66.67 
 
 		 107 aa  117  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2606  chorismate mutase  65.48 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.0121912 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0180  chorismate mutase  65.48 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14790  chorismate mutase  65.56 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165725  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1049  chorismate mutase  64.37 
 
 		 99 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2710  chorismate mutase  64.37 
 
 		 99 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719316  normal  0.0295757 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2451  chorismate mutase  67.86 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228493 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3880  chorismate mutase  66.27 
 
 		 116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367176  normal  0.891954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1123  chorismate mutase  58.95 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0349  chorismate mutase  64.29 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.365009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2720  chorismate mutase  65.48 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50851  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1825  chorismate mutase  65.22 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1757  chorismate mutase  65.22 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0750  chorismate mutase  61.9 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  65.48 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7204  chorismate mutase  60.71 
 
 		 105 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24350  monofunctional chorismate mutase  57.61 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.536021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0958  chorismate mutase  59.3 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.993568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  62.2 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1199  chorismate mutase  53.16 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0113  chorismate mutase  48.75 
 
 		 113 aa  84.3  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  28.4 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0521  chorismate mutase  34.52 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.26 
 
 		 393 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.47 
 
 		 384 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.36 
 
 		 375 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.04 
 
 		 373 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.04 
 
 		 373 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.04 
 
 		 373 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.04 
 
 		 373 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.04 
 
 		 373 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  37.04 
 
 		 373 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  37.04 
 
 		 373 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.88 
 
 		 358 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.04 
 
 		 373 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.04 
 
 		 373 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.04 
 
 		 373 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.04 
 
 		 373 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.04 
 
 		 373 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.04 
 
 		 373 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  37.04 
 
 		 373 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  40 
 
 		 381 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  36.36 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1512  DAHP synthetase I/KDSA  31.63 
 
 		 379 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.57 
 
 		 373 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.53 
 
 		 375 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  39.29 
 
 		 381 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  34.15 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  27.71 
 
 		 456 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2274  Chorismate mutase  32.61 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.53 
 
 		 373 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.53 
 
 		 373 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.57 
 
 		 373 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.53 
 
 		 377 aa  47  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.8 
 
 		 373 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.8 
 
 		 373 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.8 
 
 		 373 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.11 
 
 		 375 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1029  chorismate mutase  29.11 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.809683  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  29.11 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  37.93 
 
 		 379 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  34.21 
 
 		 375 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.25 
 
 		 375 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  37.5 
 
 		 359 aa  45.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  36.36 
 
 		 374 aa  45.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1599  chorismate mutase  29.11 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  34.88 
 
 		 386 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2453  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 366 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  34.38 
 
 		 333 aa  44.3  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1371  chorismate mutase related enzyme  33.73 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  36.71 
 
 		 360 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.38 
 
 		 374 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  41.51 
 
 		 371 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.11 
 
 		 384 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0910  chorismate mutase  28.21 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.841588  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  41.51 
 
 		 371 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1875  Chorismate mutase  32.91 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2597  hypothetical protein  33.8 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  29.76 
 
 		 399 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1146  hypothetical protein  31.52 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0377196  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.05 
 
 		 379 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  42.59 
 
 		 365 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5134  chorismate mutase  28.95 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  39.29 
 
 		 373 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>