More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1739 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
212 aa  427  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  49.76 
 
 
212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  45.41 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 
209 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  45.33 
 
 
206 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  44.39 
 
 
206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  45.1 
 
 
210 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  43.96 
 
 
213 aa  170  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  42.11 
 
 
211 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  44.17 
 
 
207 aa  168  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  40.95 
 
 
251 aa  167  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  41.95 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  44.12 
 
 
215 aa  165  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  39.61 
 
 
210 aa  165  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  41.06 
 
 
222 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  43 
 
 
206 aa  164  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  39.9 
 
 
209 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  42.44 
 
 
205 aa  162  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  40.58 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  41.55 
 
 
208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  42.38 
 
 
207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  41.63 
 
 
216 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  40.78 
 
 
211 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  40.87 
 
 
217 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  38.76 
 
 
219 aa  159  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  40.38 
 
 
219 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  42.72 
 
 
205 aa  157  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  40.19 
 
 
214 aa  157  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  40.67 
 
 
207 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  41.46 
 
 
224 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  41.95 
 
 
209 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  42.58 
 
 
214 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  39.32 
 
 
213 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  36.79 
 
 
213 aa  155  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  40.09 
 
 
213 aa  155  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 
209 aa  155  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  40.58 
 
 
213 aa  155  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 
214 aa  155  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  41.06 
 
 
213 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  38.89 
 
 
222 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  41.18 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  42.03 
 
 
258 aa  154  7e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  41.55 
 
 
210 aa  154  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  40.95 
 
 
207 aa  154  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  41.51 
 
 
218 aa  154  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  39.05 
 
 
210 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 
215 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  37.5 
 
 
215 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 
215 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  37.68 
 
 
214 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  37.32 
 
 
214 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  39.13 
 
 
205 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  37.32 
 
 
214 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  37.5 
 
 
215 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  38.21 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  41.9 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.57 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  40.69 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  38.28 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  39.51 
 
 
222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  41.9 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 
215 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  37.32 
 
 
210 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 
215 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
215 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 
209 aa  152  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  38.28 
 
 
218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  40.2 
 
 
215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  38.68 
 
 
215 aa  151  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  37.02 
 
 
212 aa  151  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  42.2 
 
 
215 aa  151  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 
209 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  37.8 
 
 
209 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  40.19 
 
 
213 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  40.76 
 
 
216 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  37.02 
 
 
215 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  41.29 
 
 
237 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  40.19 
 
 
214 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  37.02 
 
 
215 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  36.19 
 
 
214 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  36.54 
 
 
208 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  36.54 
 
 
208 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  36.36 
 
 
209 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0988  metallo-beta-lactamase family protein  38.39 
 
 
214 aa  149  4e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0520901  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  42.57 
 
 
198 aa  148  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  39.15 
 
 
213 aa  148  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  39.09 
 
 
222 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  39.71 
 
 
214 aa  148  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1077  beta-lactamase domain protein  38.79 
 
 
226 aa  148  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  39.09 
 
 
222 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  39.09 
 
 
222 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  36.36 
 
 
209 aa  148  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  40.19 
 
 
214 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  39.81 
 
 
229 aa  147  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  36.36 
 
 
209 aa  147  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.23 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  38.76 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  39.23 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  41.06 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>