More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1601 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 577 aa  1167    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0997  lysyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 569 aa  617  1e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00135477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 491 aa  507  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 		 510 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 		 497 aa  499  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 489 aa  493  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 503 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 493 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 		 501 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 532 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  54 
 
 		 504 aa  488  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 501 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 489 aa  482  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 495 aa  480  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 502 aa  479  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 503 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 		 491 aa  475  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 490 aa  478  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 561 aa  475  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 		 499 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 		 494 aa  478  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 573 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 494 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 523 aa  472  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 488 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 573 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 489 aa  472  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 492 aa  475  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 494 aa  475  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 499 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 583 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  52.64 
 
 		 491 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 499 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  50.46 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 495 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  52.74 
 
 		 496 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 515 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 504 aa  468  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 484 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  50.46 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 		 501 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 501 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 505 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 515 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 505 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  52.51 
 
 		 496 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 509 aa  462  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 562 aa  462  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 573 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 509 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0576  lysyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 506 aa  462  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0138803  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 507 aa  463  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  50.34 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  50.34 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0450  lysyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 501 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 499 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 494 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 504 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 502 aa  459  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 492 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 492 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0424  lysyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0159622  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 507 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 505 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 508 aa  456  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3975  lysyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 561 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.761967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 496 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 505 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 505 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>