202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0641 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  29.83 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  29.87 
 
 		 253 aa  95.5  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  33.89 
 
 		 278 aa  89.4  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 264 aa  89.4  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  24.27 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 271 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  38.33 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  29.18 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  35.48 
 
 		 285 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  31.74 
 
 		 318 aa  85.1  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.77 
 
 		 272 aa  85.1  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.866947  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  27.23 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  34.88 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  26.96 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  34.59 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  32.39 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  26.29 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  26.41 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  26.73 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  26.29 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  33.06 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  28.51 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  28.82 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  26.99 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  28.38 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  26.15 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  26.21 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  27.88 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  27.83 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  32.88 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  32.79 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  34.43 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  27.54 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 		 287 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  30.39 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  34.85 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  25.7 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  25.7 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  25.23 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  27.88 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  24.79 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  27.14 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  25.23 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  33.6 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  24.77 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  25.11 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  28.43 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  24.2 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  28.23 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  24.77 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  24.77 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  30.43 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  24.77 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  28.86 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  25.48 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  29.47 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  26.79 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  25.44 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  29.47 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  29.67 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  23.74 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 377 aa  68.9  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  28.16 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  24.32 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1900  hypothetical protein  33.58 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  24.32 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  24.32 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  24.32 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  24.32 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  24.32 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  29.03 
 
 		 276 aa  68.2  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  22.57 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  24.52 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  26.05 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  29.7 
 
 		 271 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  23.89 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  33.06 
 
 		 265 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  28.99 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  36.79 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  28.99 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  28.99 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>