More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1258 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  85.48 
 
 		 373 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  100 
 
 		 373 aa  771    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  85.48 
 
 		 373 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  61.79 
 
 		 372 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  61.79 
 
 		 372 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  57.22 
 
 		 386 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  56.4 
 
 		 371 aa  448  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  56.13 
 
 		 371 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  55.86 
 
 		 371 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  55.86 
 
 		 371 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  56.13 
 
 		 371 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  56.13 
 
 		 382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  55.86 
 
 		 382 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  55.86 
 
 		 382 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  56.13 
 
 		 382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  55.59 
 
 		 371 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  52.59 
 
 		 374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  52.15 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  48.28 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.72 
 
 		 430 aa  345  6e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.46 
 
 		 382 aa  344  2e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.21 
 
 		 379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.05 
 
 		 382 aa  341  1e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  48.92 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.41 
 
 		 382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.12 
 
 		 390 aa  335  7e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  46.49 
 
 		 373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.71 
 
 		 379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.21 
 
 		 380 aa  323  3e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.63 
 
 		 373 aa  316  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  42.4 
 
 		 397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.73 
 
 		 385 aa  311  1e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  41.98 
 
 		 378 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.86 
 
 		 397 aa  309  4e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  43.39 
 
 		 375 aa  309  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  41.98 
 
 		 375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.93 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  41.71 
 
 		 375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  42.41 
 
 		 389 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2156  citrate synthase 3  42.5 
 
 		 373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  42.06 
 
 		 378 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2367  citrate synthase 3  42.5 
 
 		 373 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2188  citrate synthase 3  42.5 
 
 		 372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.685723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2125  citrate synthase 3  42.5 
 
 		 372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.306637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2450  citrate synthase 3  42.5 
 
 		 373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0697754  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2348  citrate synthase 3  42.5 
 
 		 372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3010  citrate synthase 3  42.5 
 
 		 373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  43.27 
 
 		 375 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  42.33 
 
 		 375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  42.33 
 
 		 375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  42.63 
 
 		 386 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  42.63 
 
 		 386 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  42.06 
 
 		 375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2315  citrate synthase 3  42.5 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2111  citrate synthase 3  42.22 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.8 
 
 		 378 aa  302  8.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  43.01 
 
 		 375 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  41.33 
 
 		 396 aa  301  9e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  42.48 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  41.8 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1724  citrate synthase 3  42.22 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992858  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  40.27 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.38 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  42.22 
 
 		 375 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.46 
 
 		 374 aa  299  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  42.06 
 
 		 375 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.73 
 
 		 374 aa  298  8e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.28 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  42.63 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.3 
 
 		 384 aa  296  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.4 
 
 		 377 aa  296  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.28 
 
 		 372 aa  296  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  41.27 
 
 		 386 aa  296  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  41.27 
 
 		 386 aa  296  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  40.37 
 
 		 396 aa  295  9e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2376  citrate synthase 3  42.5 
 
 		 372 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.151245  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  41.18 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  39.73 
 
 		 370 aa  294  2e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  41.18 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2480  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.7 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  40.81 
 
 		 374 aa  293  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  41.42 
 
 		 377 aa  293  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  42.45 
 
 		 389 aa  292  8e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0574  citrate synthase  38.95 
 
 		 378 aa  292  8e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.86 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  40.53 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.92 
 
 		 374 aa  290  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.92 
 
 		 374 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03371  methylcitrate synthase  42.82 
 
 		 373 aa  290  4e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  41.65 
 
 		 387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  39.84 
 
 		 381 aa  289  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  42.01 
 
 		 378 aa  289  7e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0798  citrate synthase 3  40.82 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.036744  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  39.84 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  40.92 
 
 		 374 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0953  methylcitrate synthase  40.65 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  38.99 
 
 		 378 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  39.57 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  40.9 
 
 		 375 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  40.9 
 
 		 375 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>