More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1781 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1781  flavin reductase-like, FMN-binding protein  100 
 
 
179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.86 
 
 
160 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1694  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.05 
 
 
166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0487183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  42.76 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.51 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  38.82 
 
 
162 aa  107  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  36.84 
 
 
161 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  39.22 
 
 
170 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  36.02 
 
 
169 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 
169 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 
160 aa  103  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  39.29 
 
 
196 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  40 
 
 
162 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.4 
 
 
184 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  40.14 
 
 
172 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.87 
 
 
161 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.65 
 
 
165 aa  101  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  40.62 
 
 
204 aa  101  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  35.5 
 
 
193 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  44 
 
 
156 aa  101  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.33 
 
 
171 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.45 
 
 
155 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  38.01 
 
 
169 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  40.61 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  33.76 
 
 
161 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.48 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  38.52 
 
 
327 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
161 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  35.53 
 
 
161 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  41.54 
 
 
169 aa  99  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  40.12 
 
 
168 aa  99  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  35.84 
 
 
171 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  35.84 
 
 
171 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  35.84 
 
 
171 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  34.18 
 
 
161 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  35.84 
 
 
171 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  35.84 
 
 
171 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  35.84 
 
 
171 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  35.84 
 
 
171 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  33.54 
 
 
161 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  34.18 
 
 
161 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  33.54 
 
 
161 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  35.53 
 
 
161 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  33.76 
 
 
161 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  34.21 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  36.99 
 
 
174 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  41.54 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  41.54 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  33.12 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  35.63 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  36.02 
 
 
171 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.25 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.06 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  39.1 
 
 
174 aa  95.5  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  34.21 
 
 
161 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5310  flavoprotein oxidoreductase  36.3 
 
 
181 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00829883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.85 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  35.36 
 
 
187 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.77 
 
 
169 aa  95.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  44 
 
 
164 aa  95.5  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  38.06 
 
 
168 aa  94.7  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  40.88 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  35.37 
 
 
169 aa  94.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
393 aa  94.7  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  40.77 
 
 
169 aa  94.4  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  40.77 
 
 
169 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  40.77 
 
 
169 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  40.77 
 
 
169 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  38.96 
 
 
170 aa  94.4  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  35.26 
 
 
172 aa  94.4  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.71 
 
 
169 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 
186 aa  94  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  31.64 
 
 
188 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4507  flavin reductase-like, FMN-binding  42.24 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.657354  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  37.01 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.62 
 
 
190 aa  92.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.48 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  37.42 
 
 
170 aa  92.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.3 
 
 
330 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  41.33 
 
 
156 aa  92  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  32.98 
 
 
204 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  38.82 
 
 
177 aa  91.7  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  39.19 
 
 
161 aa  91.3  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.71 
 
 
311 aa  91.3  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
188 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
188 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  34.87 
 
 
160 aa  90.5  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  41.83 
 
 
181 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  34.86 
 
 
175 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  34.59 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  34.59 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.13 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  35.57 
 
 
313 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  33.83 
 
 
226 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  42.42 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  34.87 
 
 
157 aa  89.4  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  39.49 
 
 
175 aa  89  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  36.73 
 
 
167 aa  89  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
393 aa  89  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>