More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1405 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  100 
 
 		 345 aa  679    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.79 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  34.99 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  33.62 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.99 
 
 		 347 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  32.54 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  35.67 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  36.1 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.28 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.1 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.23 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  32.29 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.34 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.95 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  35 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.34 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.17 
 
 		 357 aa  166  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.38 
 
 		 361 aa  165  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  32.26 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.66 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  33.61 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  35.14 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  33.52 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  32.49 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.37 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.99 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  31.69 
 
 		 338 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  29.1 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  31.37 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  34.15 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  33.62 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5067  membrane-associated zinc metalloprotease  33.7 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  32.21 
 
 		 369 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.55 
 
 		 368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.59 
 
 		 351 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 		 377 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  34.47 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.17 
 
 		 380 aa  150  4e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  33.24 
 
 		 363 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  34.64 
 
 		 356 aa  149  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.29 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.7 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  35.59 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  35.88 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.6 
 
 		 372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.33 
 
 		 367 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.31 
 
 		 347 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.93 
 
 		 355 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  33.24 
 
 		 354 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  32.96 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  32.13 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  32.85 
 
 		 353 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  33.43 
 
 		 367 aa  142  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  32.22 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.71 
 
 		 374 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.66 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  34.56 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  32.19 
 
 		 384 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  31.04 
 
 		 373 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  33.24 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.23 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  28.9 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  33.24 
 
 		 360 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.87 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  30.89 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  32.36 
 
 		 361 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2406  membrane-associated zinc metalloprotease  32.36 
 
 		 361 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  30.75 
 
 		 386 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  32.97 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  30.11 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2601  peptidase M50  31.82 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0673098  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  30.81 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  29.95 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13901  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  32.03 
 
 		 359 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13821  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  32.03 
 
 		 359 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.46 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  29.67 
 
 		 375 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.19 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1818  peptidase M50  30.14 
 
 		 371 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0171111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  30.5 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  31.46 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.9 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.91 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  31.91 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.18 
 
 		 383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  31.18 
 
 		 386 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0860  RIP metalloprotease RseP  29.34 
 
 		 370 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.14 
 
 		 353 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0352  peptidase M50  29.68 
 
 		 345 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  31.18 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16631  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  32.63 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.24545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.15 
 
 		 383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  30.7 
 
 		 412 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.71 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0808  hypothetical protein  32.63 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.52114  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1290  hypothetical protein  31.55 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.62255  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3629  peptidase M50  30.58 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0260  peptidase M50  39.41 
 
 		 496 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1043  peptidase M50  27.01 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0249274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>