80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0792 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  100 
 
 		 337 aa  667    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  35.57 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  34.64 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  32.8 
 
 		 363 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  32.28 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  32.48 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  29.39 
 
 		 329 aa  129  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  31.18 
 
 		 347 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  33.55 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  30.18 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  28.27 
 
 		 366 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  29.91 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  29.62 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  28.9 
 
 		 342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  25.81 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  24.17 
 
 		 347 aa  108  9.000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  29.64 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  23.91 
 
 		 354 aa  106  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  31.28 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  31.02 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  29.39 
 
 		 377 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  28.75 
 
 		 357 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  28 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  25.78 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  31.55 
 
 		 364 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  32.22 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  31.84 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  27.45 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  24.13 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  31.25 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  24.66 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  24.66 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  26.04 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  27.39 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  29.13 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  22.12 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  23.87 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  30.56 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  27.36 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  30.54 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  27.39 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  32.61 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  30.86 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  26.71 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  34.95 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  23.12 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.35 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  25.53 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.16 
 
 		 344 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  22.22 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  26.29 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5671  hypothetical protein  20.08 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.597001  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  24.28 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1027  hypothetical protein  24.72 
 
 		 426 aa  54.3  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  26.92 
 
 		 753 aa  52.8  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  30.86 
 
 		 445 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  30.86 
 
 		 445 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  19.9 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  25.99 
 
 		 362 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2852  hypothetical protein  20.22 
 
 		 293 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000023268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  26.24 
 
 		 345 aa  49.7  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1399  hypothetical protein  29.44 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  30.43 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  30.43 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  22.82 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  25.7 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  23.57 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2001  fmhA protein  27.55 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  22.43 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  26.8 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  24.86 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  26.8 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  22.37 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  24.87 
 
 		 351 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  25.44 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.4 
 
 		 356 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0767  hypothetical protein  27.53 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  25.14 
 
 		 360 aa  42.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.3 
 
 		 368 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>