More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0513 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
233 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.66 
 
 
239 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.5 
 
 
238 aa  255  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  6.33587e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.86 
 
 
237 aa  254  1e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.93 
 
 
238 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.06 
 
 
240 aa  244  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.07 
 
 
227 aa  239  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.84 
 
 
229 aa  234  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.33 
 
 
229 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.85 
 
 
239 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
237 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
248 aa  184  1e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.72 
 
 
236 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.29 
 
 
236 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 
265 aa  173  2e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  43.25 
 
 
257 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.74 
 
 
236 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 
241 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  42.04 
 
 
245 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01679  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase  42.06 
 
 
242 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
250 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
252 aa  166  3e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
241 aa  164  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
244 aa  162  4e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.98 
 
 
240 aa  161  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
270 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
250 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
242 aa  158  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
247 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
233 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
257 aa  151  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 
246 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 
245 aa  148  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  3.5289e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
245 aa  147  2e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 
246 aa  146  2e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
244 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
243 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
245 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6948  putative short chain oxidoreductase  54.36 
 
 
129 aa  144  8e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
260 aa  144  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
272 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  30.51 
 
 
236 aa  140  2e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  30.51 
 
 
236 aa  140  2e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  41.49 
 
 
244 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
251 aa  139  4e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  29.24 
 
 
236 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
235 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  30.93 
 
 
236 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 
263 aa  135  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
250 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
248 aa  132  4e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
237 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
232 aa  127  1e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
249 aa  127  2e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
246 aa  126  2e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
244 aa  127  2e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
231 aa  126  4e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.41 
 
 
265 aa  125  8e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
232 aa  123  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
257 aa  122  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
261 aa  121  1e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
233 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  34.75 
 
 
251 aa  119  4e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
232 aa  119  5e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.02 
 
 
248 aa  117  1e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  5.36759e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.54 
 
 
248 aa  118  1e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
269 aa  117  1e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
256 aa  117  2e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.49 
 
 
246 aa  117  2e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 
234 aa  117  2e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.58 
 
 
246 aa  117  2e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 
234 aa  117  2e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
249 aa  117  2e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 
250 aa  117  2e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
254 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  0.250737 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  36.79 
 
 
236 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
232 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  33.84 
 
 
247 aa  116  4e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 
225 aa  115  4e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31851  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
261 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
255 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.89 
 
 
256 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5189  gluconate 5-dehydrogenase (5-keto-D-gluconate 5- reductase)  41.63 
 
 
261 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  34.87 
 
 
193 aa  115  7e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.88 
 
 
262 aa  115  7e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3079  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.11 
 
 
257 aa  114  1e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16790  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.15 
 
 
253 aa  114  1e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.821391 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  36.76 
 
 
252 aa  114  1e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2808  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.32 
 
 
244 aa  113  2e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  2.27771e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1400  short chain dehydrogenase  32.24 
 
 
264 aa  114  2e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.473326  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1587  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.39 
 
 
244 aa  114  2e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  6.00536e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
225 aa  114  2e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  37.57 
 
 
240 aa  113  2e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
232 aa  113  2e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
225 aa  114  2e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  35.35 
 
 
232 aa  113  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  39.36 
 
 
248 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
263 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2503  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.32 
 
 
244 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  6.90955e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
269 aa  112  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>