225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3099 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  98.83 
 
 		 256 aa  517  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  92.16 
 
 		 256 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  88.24 
 
 		 256 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  53.91 
 
 		 257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  56.18 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  52.59 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  51.59 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  53.36 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  53.6 
 
 		 255 aa  264  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  53.17 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  52.61 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  54.51 
 
 		 256 aa  261  8.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  51.41 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  51.19 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  51.18 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 251 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  52.19 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 255 aa  241  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  49.41 
 
 		 255 aa  241  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  51 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 		 255 aa  238  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  48.8 
 
 		 252 aa  238  9e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  48.18 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  46.67 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  49.61 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1497  LamB/YcsF family protein  52.19 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  50.8 
 
 		 304 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1386  LamB/YcsF family protein  51.2 
 
 		 266 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.624042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  46.56 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 		 256 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  45.85 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  48.61 
 
 		 260 aa  228  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 		 253 aa  228  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  46.27 
 
 		 256 aa  228  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  47.64 
 
 		 256 aa  228  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  48.63 
 
 		 262 aa  228  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  42.11 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  42.57 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  44 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 		 255 aa  221  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  48.62 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  46.46 
 
 		 254 aa  220  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  44.09 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  44.62 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2055  LamB/YcsF family protein  47.83 
 
 		 257 aa  218  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  42.91 
 
 		 253 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  42.91 
 
 		 253 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  43.32 
 
 		 253 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  42.86 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  48.56 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  46.46 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  46.61 
 
 		 261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  44.72 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  42 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  42 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  42 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  40.71 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  44.8 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  45.85 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  44.8 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0803  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.179932  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  47.18 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  47.18 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 		 245 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 245 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 245 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 245 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  46 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  43.24 
 
 		 259 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  45.6 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  46.56 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  44.4 
 
 		 252 aa  205  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2131  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 260 aa  204  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0871  LamB/YcsF family protein  46.34 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0822  LamB/YcsF family protein  46.34 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0506032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>