163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0852 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  100 
 
 
248 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  87.5 
 
 
248 aa  437  1e-122  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  87.9 
 
 
254 aa  440  1e-122  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  68.57 
 
 
249 aa  323  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  63.35 
 
 
251 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  62.55 
 
 
247 aa  298  5e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  58.7 
 
 
249 aa  268  7e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  47.56 
 
 
256 aa  212  4e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  48.03 
 
 
265 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  51.56 
 
 
264 aa  208  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  48.36 
 
 
290 aa  205  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  50.63 
 
 
257 aa  199  4e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  47.81 
 
 
252 aa  197  1e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  48.74 
 
 
255 aa  196  2e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  48.7 
 
 
257 aa  196  2e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  46.72 
 
 
244 aa  195  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  51.28 
 
 
252 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  47.06 
 
 
261 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  48.62 
 
 
264 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  50 
 
 
258 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  40.8 
 
 
272 aa  191  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  46.52 
 
 
259 aa  189  3e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  52.65 
 
 
252 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  48.35 
 
 
265 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  48.93 
 
 
271 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  44.62 
 
 
261 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  46.09 
 
 
263 aa  184  1e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  48.07 
 
 
283 aa  182  4e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  44.49 
 
 
647 aa  179  3e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  45.95 
 
 
272 aa  179  3e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  37.55 
 
 
253 aa  179  4e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  42.52 
 
 
254 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  41.3 
 
 
257 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  42.42 
 
 
269 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  40.6 
 
 
259 aa  173  2e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  40.87 
 
 
274 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  40.68 
 
 
277 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  33.6 
 
 
260 aa  168  8e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  49.32 
 
 
265 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  34.17 
 
 
257 aa  166  4e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  38.89 
 
 
279 aa  164  1e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  41.99 
 
 
248 aa  147  2e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  31.86 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  31.86 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.40392e-07  hitchhiker  9.02529e-10 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.7 
 
 
259 aa  62  8e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  39.56 
 
 
239 aa  60.5  3e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34489  predicted protein  24.34 
 
 
280 aa  60.1  3e-08  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.75 
 
 
261 aa  60.1  3e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  27.36 
 
 
413 aa  58.9  6e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  28.02 
 
 
286 aa  58.2  1e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  25.81 
 
 
258 aa  58.2  1e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  27.4 
 
 
415 aa  57.4  2e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  1.34708e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  31.06 
 
 
237 aa  57  3e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  27.42 
 
 
408 aa  54.7  1e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  27.46 
 
 
251 aa  54.7  1e-06  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 
260 aa  54.3  2e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.26151e-06  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  37.65 
 
 
275 aa  54.3  2e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  28.48 
 
 
257 aa  54.3  2e-06  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  29.33 
 
 
246 aa  53.9  2e-06  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  28.48 
 
 
257 aa  53.1  4e-06  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  27.57 
 
 
259 aa  53.1  4e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  28.11 
 
 
412 aa  52.4  6e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  25.76 
 
 
268 aa  52.4  7e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  23.5 
 
 
254 aa  51.6  1e-05  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  33.02 
 
 
402 aa  51.6  1e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  23.18 
 
 
274 aa  50.1  3e-05  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  30 
 
 
214 aa  50.1  4e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0820  carboxyesterase precursor-like protein  22.47 
 
 
246 aa  49.7  4e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  39.81 
 
 
260 aa  50.1  4e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0804  esterase/lipase-like protein  22.47 
 
 
246 aa  49.7  4e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00548514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.74 
 
 
370 aa  49.3  5e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.5 
 
 
368 aa  49.3  6e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  23.85 
 
 
405 aa  48.9  7e-05  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  28.23 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  26.82 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.97 
 
 
370 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1361  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 
305 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000732277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1387  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 
305 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
273 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 
274 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  30.47 
 
 
260 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.25 
 
 
368 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02720  conserved hypothetical protein  24.18 
 
 
295 aa  46.2  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.539212 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 
369 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 
369 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.7 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 
369 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.25 
 
 
368 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4297  prolyl oligopeptidase family protein  27.03 
 
 
242 aa  45.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  34.96 
 
 
262 aa  45.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 
274 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.61 
 
 
371 aa  46.2  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  29.17 
 
 
257 aa  45.8  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05110  expressed protein  29.38 
 
 
384 aa  45.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
270 aa  45.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  28.7 
 
 
397 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  25.35 
 
 
324 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>