More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0746 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  55.72 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  61.36 
 
 		 194 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  50.25 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  50.25 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  47.85 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  51.02 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  51.02 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  51.02 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  51.02 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  51.02 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  51.02 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  51.02 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  51.02 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  46.85 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  44.07 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  38.89 
 
 		 240 aa  99  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  33.93 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  28.5 
 
 		 249 aa  91.7  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  34.07 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  36.54 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  33.15 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  36.6 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  34.97 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  36.6 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  32.75 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  33.94 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  33.88 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  32.31 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  33.92 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  36.36 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  41.38 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  31.33 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  32.42 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  40.34 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  35.42 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  32.8 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.17 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  36.13 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  31.29 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  27.17 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  28.72 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4825  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.12 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1435  SNARE associated Golgi protein  33.6 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000156702  decreased coverage  0.000261969 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  28.04 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.91 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  30.59 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  32.45 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  32.5 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  32.5 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  28.39 
 
 		 735 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  31.85 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  34.19 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  30.82 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  28.95 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  34.85 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  30.25 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  38.04 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  27.12 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  27.12 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  27.12 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  27.12 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  27.12 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  27.97 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  27.12 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  27.12 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  31.18 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  31.36 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  25.79 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  25.79 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  27.18 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  33.8 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  33.95 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  29.73 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  33.95 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  33.95 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  30.71 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.53 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  29.89 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  29.56 
 
 		 623 aa  62  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  32.81 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  28.83 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1854  hypothetical protein  29.23 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  28.83 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  30.41 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  31.11 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  24.84 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  33.86 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  32.32 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  30.41 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  33.77 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  32.32 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  24.7 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  27.89 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  31.31 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  29.73 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  24.24 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>