118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0877 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  696    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  46.41 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  47.21 
 
 		 347 aa  315  9e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  45.88 
 
 		 347 aa  306  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  36.83 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  27.62 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  28.75 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  30.46 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  33.94 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  31.02 
 
 		 374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  29.47 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  30.86 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  29.38 
 
 		 373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  30.85 
 
 		 352 aa  113  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  31.31 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  30.4 
 
 		 543 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  30.94 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  28.01 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  28.53 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  30.75 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  30.96 
 
 		 348 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  27.94 
 
 		 346 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  32.28 
 
 		 318 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  28.44 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  30.35 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  28.57 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  31.3 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  29.51 
 
 		 342 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  24.35 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  29.57 
 
 		 330 aa  89.7  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  31.61 
 
 		 318 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  30.65 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  29.1 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  28.21 
 
 		 607 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  30.86 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  30.86 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  30.37 
 
 		 339 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  29.45 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  32.47 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  28.93 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  30.65 
 
 		 546 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  33.95 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  30.89 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  27.44 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  30.05 
 
 		 605 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  27.04 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  27.75 
 
 		 568 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  27.35 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  27.91 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  27.96 
 
 		 569 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  28.22 
 
 		 572 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  24.62 
 
 		 601 aa  77  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  28.36 
 
 		 572 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  26.51 
 
 		 568 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  25.66 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  28.87 
 
 		 551 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  35.15 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  28.4 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  33.14 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  28.12 
 
 		 545 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  32.14 
 
 		 410 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  34.73 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  27.2 
 
 		 533 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  35.48 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  33.54 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  24.48 
 
 		 567 aa  69.7  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  25.11 
 
 		 542 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  32.52 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  26.3 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  25.21 
 
 		 565 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  23.02 
 
 		 567 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  27.08 
 
 		 600 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  27.08 
 
 		 600 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  30.89 
 
 		 526 aa  63.2  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  28.36 
 
 		 498 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  31.39 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.16 
 
 		 382 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  38.98 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.07 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  41.03 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  37.29 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.29 
 
 		 488 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16690  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  30.05 
 
 		 461 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.400714 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  33.61 
 
 		 498 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  31.19 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  36.84 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  31.95 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  35 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15401  putative dienelactone hydrolase  31.36 
 
 		 531 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  22.18 
 
 		 571 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0706  fused serine peptidase/N-terminal uncharacterized domain protein  25 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.358194  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  32.37 
 
 		 322 aa  50.4  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  31.4 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  21.77 
 
 		 570 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  32.57 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.67 
 
 		 706 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.4 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  33.6 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  34.65 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  26.67 
 
 		 468 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>