More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0465 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 299 aa  584  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  50.33 
 
 		 296 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  47.84 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  49.32 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  49.5 
 
 		 295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  54.75 
 
 		 289 aa  251  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  49.33 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  50.17 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  49.67 
 
 		 297 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  48.66 
 
 		 295 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  47.84 
 
 		 299 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  51 
 
 		 297 aa  248  7e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  49.32 
 
 		 291 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  47.84 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  50.66 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  51.15 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  49.34 
 
 		 309 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  46.49 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  53.26 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  53.44 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  50.52 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  45.48 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  47.51 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  51.69 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  47.51 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  47.51 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  48.36 
 
 		 297 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  46.26 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  50.16 
 
 		 298 aa  228  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  54.42 
 
 		 226 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  54.66 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  48.14 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  47 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  46.59 
 
 		 291 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  48.84 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  49.16 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  44.57 
 
 		 432 aa  202  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  48.84 
 
 		 419 aa  198  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  42.34 
 
 		 398 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  44.26 
 
 		 409 aa  189  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  44.66 
 
 		 414 aa  183  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  48.84 
 
 		 429 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  45.58 
 
 		 403 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  45.12 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  44.35 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  47.79 
 
 		 420 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  38.15 
 
 		 435 aa  179  7e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  40.75 
 
 		 429 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  40.38 
 
 		 404 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  45.5 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  43.81 
 
 		 406 aa  176  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  43.36 
 
 		 407 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  46.38 
 
 		 410 aa  175  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  44.19 
 
 		 409 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  37.83 
 
 		 415 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  42.99 
 
 		 406 aa  171  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  42.79 
 
 		 438 aa  170  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  37.83 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  44.19 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  37.5 
 
 		 404 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  39.18 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  39.18 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  38.87 
 
 		 429 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  40.81 
 
 		 404 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  39.54 
 
 		 404 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 		 215 aa  169  8e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  44.65 
 
 		 326 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  44.65 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  44.65 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  45.71 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  41.77 
 
 		 325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  42.99 
 
 		 404 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  41.44 
 
 		 410 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  36.94 
 
 		 418 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  43.6 
 
 		 408 aa  166  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  41.12 
 
 		 418 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  48.47 
 
 		 223 aa  166  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  47.44 
 
 		 421 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  40.57 
 
 		 411 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  37.68 
 
 		 410 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  39.34 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  41.74 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  43.41 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  41.92 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  38.5 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  46.05 
 
 		 410 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  42.79 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  42.99 
 
 		 406 aa  162  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  41.05 
 
 		 412 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  43.9 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  44.39 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  44.39 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  44.39 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  44.39 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  44.39 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  43.78 
 
 		 322 aa  162  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  47.91 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  45.45 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>