263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2240 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 297 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  88.55 
 
 		 297 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  81.36 
 
 		 297 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  74.58 
 
 		 297 aa  420  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  71.53 
 
 		 296 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  90.27 
 
 		 226 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  67.57 
 
 		 299 aa  351  8e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  77.64 
 
 		 241 aa  349  4e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  62.42 
 
 		 298 aa  342  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  64.65 
 
 		 298 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  61.15 
 
 		 299 aa  328  8e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  60.81 
 
 		 299 aa  326  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  62.5 
 
 		 325 aa  321  9.000000000000001e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  59.06 
 
 		 295 aa  318  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  59.46 
 
 		 299 aa  316  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  58.45 
 
 		 295 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  59.12 
 
 		 298 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  56.76 
 
 		 296 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  55.93 
 
 		 296 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  56.23 
 
 		 309 aa  309  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  58.39 
 
 		 298 aa  308  8e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  58.72 
 
 		 298 aa  308  9e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  56.95 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  58.31 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  58.92 
 
 		 297 aa  292  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  55.44 
 
 		 291 aa  286  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  55.97 
 
 		 291 aa  285  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  54.24 
 
 		 291 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  53.9 
 
 		 291 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  59.49 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  54.76 
 
 		 292 aa  265  7e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  51.9 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  58.15 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  51.36 
 
 		 292 aa  249  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  51.7 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  47.96 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  45.42 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  51.13 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  51.53 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  45.85 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  46.22 
 
 		 420 aa  175  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  46.09 
 
 		 419 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  44.35 
 
 		 432 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  48.02 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  44.69 
 
 		 411 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  40.34 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  43.72 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  44.27 
 
 		 429 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  48.31 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  45.63 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  45.63 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  45.63 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  43.6 
 
 		 400 aa  166  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  44.08 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  47.78 
 
 		 302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  44.08 
 
 		 400 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  44.35 
 
 		 435 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  43.57 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  44.78 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  41.74 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  41.8 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  42.8 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  43.29 
 
 		 325 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  45.08 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  45.63 
 
 		 325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  41.8 
 
 		 429 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  41.84 
 
 		 410 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  40.98 
 
 		 418 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  50.26 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  40.98 
 
 		 418 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  40.57 
 
 		 429 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  43.04 
 
 		 404 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  43.43 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  43.56 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  43.56 
 
 		 326 aa  159  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  41.29 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  43.36 
 
 		 404 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  42.48 
 
 		 325 aa  158  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  47.57 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  45.15 
 
 		 325 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  42.98 
 
 		 413 aa  157  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  43.4 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  43.17 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  42.92 
 
 		 404 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  43.59 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  48.79 
 
 		 241 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  43.48 
 
 		 407 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  43.17 
 
 		 404 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  44.84 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  43.84 
 
 		 419 aa  155  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  44.3 
 
 		 410 aa  155  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  41.28 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  48.92 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  38.77 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  40.25 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  44.44 
 
 		 328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  45.81 
 
 		 454 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  41.07 
 
 		 398 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  44.17 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  46.23 
 
 		 281 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>