More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2840 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  85.11 
 
 		 403 aa  652    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 403 aa  795    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  53.38 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0066  glycosyl transferase group 1  48.77 
 
 		 403 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.918731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  39.23 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  36.28 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  37.12 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 		 475 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 409 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.05 
 
 		 401 aa  93.2  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  24.23 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  22.38 
 
 		 416 aa  89.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  32 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 445 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 		 428 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  36.63 
 
 		 399 aa  87  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  39.39 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  34.02 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0355  glycosyl transferase, group 1  21.55 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  30.14 
 
 		 723 aa  82.4  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  21.57 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.02 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.73 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.27 
 
 		 495 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.27 
 
 		 499 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.73 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.73 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  35.94 
 
 		 569 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.27 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.73 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  33.86 
 
 		 603 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  33.57 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0995  CheY protein  24.24 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.7 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  26.98 
 
 		 650 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 535 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  36.18 
 
 		 557 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 507 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>