More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0917 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 162 aa  320  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  92.5 
 
 		 162 aa  295  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  78.77 
 
 		 154 aa  243  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  45.38 
 
 		 225 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  41.35 
 
 		 256 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  36.5 
 
 		 219 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  45 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  38.35 
 
 		 223 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  35.88 
 
 		 230 aa  95.1  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  39.69 
 
 		 202 aa  94.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  40.14 
 
 		 210 aa  94.4  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  43.07 
 
 		 216 aa  94.4  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  42.34 
 
 		 216 aa  93.6  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  39.55 
 
 		 227 aa  91.7  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  37.96 
 
 		 208 aa  90.9  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  39.42 
 
 		 209 aa  91.3  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  38.06 
 
 		 214 aa  90.1  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  37.23 
 
 		 210 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  35.77 
 
 		 220 aa  89  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  40 
 
 		 212 aa  87.8  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  32.85 
 
 		 224 aa  87.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  40 
 
 		 212 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 215 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  36.96 
 
 		 144 aa  85.1  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  35.34 
 
 		 219 aa  84.3  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  37.96 
 
 		 214 aa  84  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  31.58 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  40.77 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  34.29 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  32.09 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  35.82 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  39.84 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  33.1 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  39.13 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  33.79 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  36.43 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  36.05 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  37.69 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  34.11 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  36.05 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  34.11 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  37.75 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  34.11 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  40.74 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  31.61 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  35.59 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  33.1 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  38.4 
 
 		 279 aa  70.9  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  33.57 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  37.59 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  32.85 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  40.16 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  30.71 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  36 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  36.81 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  33.08 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  35.43 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  33.08 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  34.78 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  33.06 
 
 		 513 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  35.2 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  32.68 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  37.3 
 
 		 867 aa  68.9  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  33.06 
 
 		 513 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 		 636 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  29.23 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 252 aa  67.8  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  34.33 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  29.05 
 
 		 426 aa  67.8  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  32.33 
 
 		 398 aa  67.4  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  33.33 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  33.06 
 
 		 513 aa  67.8  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  33.1 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  31.76 
 
 		 269 aa  67.4  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  39.02 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  39.02 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  34.06 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  39.02 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0089  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36 
 
 		 494 aa  65.9  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0800118  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  32.47 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  40.94 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  35.43 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  38.64 
 
 		 640 aa  65.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  46.4 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  37.69 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  32.68 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  32.68 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  32.54 
 
 		 381 aa  64.7  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1344 aa  64.7  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  37.4 
 
 		 845 aa  64.3  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  32.89 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  30.65 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  33.06 
 
 		 513 aa  63.9  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>