More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0168 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  89.82 
 
 		 395 aa  704    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  100 
 
 		 409 aa  818    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  65.81 
 
 		 398 aa  509  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  58.42 
 
 		 394 aa  472  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  60.51 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  57.29 
 
 		 389 aa  450  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  56.38 
 
 		 384 aa  448  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  58.42 
 
 		 388 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  54.22 
 
 		 394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  55.78 
 
 		 384 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  58.06 
 
 		 398 aa  443  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  53.55 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  56.27 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  54.96 
 
 		 400 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  53.55 
 
 		 392 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  53.44 
 
 		 398 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  54.22 
 
 		 393 aa  428  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  54.2 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  54.59 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  53.2 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  55.1 
 
 		 399 aa  423  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  53.08 
 
 		 403 aa  421  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  53.06 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  52.27 
 
 		 398 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  52.27 
 
 		 398 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  52.39 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  53.05 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  55.1 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  53.96 
 
 		 390 aa  398  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  53.35 
 
 		 382 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  51.53 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  51.79 
 
 		 383 aa  393  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  51.15 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  52.44 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  51.94 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  47.95 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  51.66 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  50.77 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  51.26 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  51.34 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  51.66 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  48.72 
 
 		 403 aa  362  8e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  50.38 
 
 		 400 aa  362  9e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.46 
 
 		 400 aa  361  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  49.23 
 
 		 381 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.76 
 
 		 388 aa  360  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  50.65 
 
 		 380 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 		 384 aa  358  8e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  48.72 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  48.84 
 
 		 381 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  48.98 
 
 		 403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  49.11 
 
 		 417 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  49.49 
 
 		 403 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  48.89 
 
 		 436 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  48.89 
 
 		 436 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  48.08 
 
 		 393 aa  355  5.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  48.59 
 
 		 389 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  48.58 
 
 		 381 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  49.36 
 
 		 401 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  48.21 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  49.13 
 
 		 422 aa  355  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  48.47 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  48.21 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  48.21 
 
 		 407 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  48.06 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  48.21 
 
 		 407 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  48.21 
 
 		 407 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  48.21 
 
 		 407 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  47.31 
 
 		 391 aa  354  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  48.58 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  49.25 
 
 		 389 aa  353  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  48.06 
 
 		 381 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  50.51 
 
 		 405 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  47.96 
 
 		 405 aa  352  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  47.96 
 
 		 407 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  46.79 
 
 		 402 aa  352  5e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  48.21 
 
 		 407 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  47.96 
 
 		 407 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  47.96 
 
 		 407 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  47.96 
 
 		 407 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  47.96 
 
 		 407 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  47.96 
 
 		 407 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  47.8 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  47.8 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  47.7 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  47.8 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  47.96 
 
 		 407 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  47.31 
 
 		 407 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  49.74 
 
 		 408 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 		 389 aa  350  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  49.36 
 
 		 389 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  47.03 
 
 		 381 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  47.56 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  48.09 
 
 		 391 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  46.56 
 
 		 391 aa  346  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  46.77 
 
 		 381 aa  346  4e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  53.14 
 
 		 377 aa  346  5e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  48.22 
 
 		 400 aa  346  5e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  46.15 
 
 		 386 aa  346  5e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>