169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0497 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  100 
 
 		 266 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  79.31 
 
 		 276 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  65.2 
 
 		 265 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  65.55 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  63.45 
 
 		 251 aa  291  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0488  AzlC family protein  62.5 
 
 		 264 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  59.75 
 
 		 251 aa  285  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  59.58 
 
 		 251 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  59.58 
 
 		 272 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  59.58 
 
 		 272 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  58.13 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  58.13 
 
 		 251 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  59.76 
 
 		 249 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  59.76 
 
 		 249 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  60.08 
 
 		 253 aa  271  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0475  AzlC family protein  61.18 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3279  AzlC family protein  63.45 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  59.35 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0294  AzlC family protein  59.35 
 
 		 249 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0589  AzlC family protein  59.35 
 
 		 249 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2422  AzlC family protein  59.35 
 
 		 249 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0035  AzlC family protein  59.35 
 
 		 249 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5961  AzlC-like efflux pump  58.94 
 
 		 251 aa  261  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  45.22 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3399  AzlC family protein  51.17 
 
 		 249 aa  191  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4054  AzlC family protein  50.7 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.557844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0830  AzlC family protein  45.02 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0287  hypothetical protein  46.4 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4691  AzlC family protein  50.8 
 
 		 288 aa  165  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  41.04 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  42.7 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  42.54 
 
 		 259 aa  151  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  39.91 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4080  AzlC family protein  48.39 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  35.65 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  35.32 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  30.37 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  34.83 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  34.09 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  33.64 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  30.8 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  30.84 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  30.94 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  32.08 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  28.97 
 
 		 234 aa  97.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  28.27 
 
 		 234 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  30.19 
 
 		 257 aa  95.9  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  30.88 
 
 		 228 aa  95.1  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  29.48 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  29.48 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  29.6 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  33.33 
 
 		 253 aa  92  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  29.41 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  29.41 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  29.6 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  29.44 
 
 		 238 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  28.38 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  30.18 
 
 		 286 aa  89.7  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  26.77 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  31.2 
 
 		 255 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  29.86 
 
 		 235 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  28.34 
 
 		 273 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  29.22 
 
 		 250 aa  89  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  33.61 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  33.61 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  33.61 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  32.03 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  33.2 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  31 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  28.7 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  30.73 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  29.61 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  27.78 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  30.04 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  28.24 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  29.22 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  28.95 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  28.44 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  27.9 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  30.26 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  26.07 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  29.74 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  31.68 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  31.68 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  31.68 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  31.68 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  31.68 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  31.68 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  28.21 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  26 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  33.33 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  29.11 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  25.82 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  32.42 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  32.42 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  29.31 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  28.09 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  25.86 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  30.19 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  30.14 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>