More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1789 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 261 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  44.14 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  41.2 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  44.49 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  39.55 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0899  ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 		 287 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0950  ABC-2 type transporter  43.56 
 
 		 288 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0948  ABC-2 type transporter  43.56 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0389515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  43.6 
 
 		 665 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.89 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.27 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.25 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.35 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  39.17 
 
 		 270 aa  135  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.43 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  35.62 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.6 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.98 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  29.72 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  33.79 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  32.27 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  34.84 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  34.4 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  32.17 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  38.29 
 
 		 285 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  34.21 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.63 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.09 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  28.3 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.94 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  33.03 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.64 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  35.94 
 
 		 280 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.88 
 
 		 253 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.56 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.56 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  31.33 
 
 		 278 aa  95.5  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  35.62 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  34.63 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  27.78 
 
 		 284 aa  89.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  33.82 
 
 		 256 aa  89  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  27.03 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  31.74 
 
 		 269 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  28.75 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  23.87 
 
 		 254 aa  85.9  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  26.41 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  26.64 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  27.06 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1281  ABC transporter, permease protein  27.43 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640698  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  27.23 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  28.29 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  29.77 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  29.2 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  30.73 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1239  hypothetical protein  32.17 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0798004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  30.05 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  30.05 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.73 
 
 		 360 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  32 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4979  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  24.76 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  26.71 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1945  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0850168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>