163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5500 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 
453 aa  915    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7496  MmgE/PrpD family protein  39.69 
 
 
469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000196116  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0572  MmgE/PrpD family protein  40.94 
 
 
457 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  36.85 
 
 
443 aa  239  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  35.75 
 
 
451 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2474  MmgE/PrpD family protein  36.55 
 
 
444 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288716  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2252  MmgE/PrpD family protein  32.35 
 
 
456 aa  170  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  30.62 
 
 
441 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  28.61 
 
 
453 aa  157  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  29.49 
 
 
451 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3057  MmgE/PrpD family protein  28 
 
 
450 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  28.16 
 
 
454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  30.39 
 
 
454 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  31.52 
 
 
441 aa  133  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2358  MmgE/PrpD  30.18 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  27.71 
 
 
455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  28.29 
 
 
450 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  29.34 
 
 
454 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  30.05 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  28.1 
 
 
456 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  27.32 
 
 
450 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  28.12 
 
 
459 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  28.54 
 
 
460 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  29.2 
 
 
449 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  27.86 
 
 
462 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  30.48 
 
 
454 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  26.46 
 
 
449 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  28.67 
 
 
463 aa  123  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  27.9 
 
 
457 aa  123  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  29.56 
 
 
461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  29.08 
 
 
450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  29.16 
 
 
464 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  28.7 
 
 
453 aa  119  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  29.16 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  28.09 
 
 
494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  27.89 
 
 
454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  25.22 
 
 
449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  27.94 
 
 
454 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  27.18 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  30.34 
 
 
476 aa  117  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  26.73 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  26.76 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 
501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  26.52 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  23.62 
 
 
446 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  28.5 
 
 
451 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  26.46 
 
 
504 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  26.61 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  22.74 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  25.45 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  26.9 
 
 
455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  25.57 
 
 
451 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  26.32 
 
 
474 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  27.19 
 
 
481 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  26.84 
 
 
451 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  24.83 
 
 
482 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  28.54 
 
 
453 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  23.79 
 
 
446 aa  106  8e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  28.09 
 
 
458 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  25.06 
 
 
449 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  26 
 
 
457 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  28.24 
 
 
458 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  24.24 
 
 
488 aa  103  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  27.84 
 
 
458 aa  103  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  25.76 
 
 
481 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  26.91 
 
 
457 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  26.49 
 
 
443 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  32.2 
 
 
468 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  25.46 
 
 
442 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  29.58 
 
 
445 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  24.18 
 
 
457 aa  100  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  29.05 
 
 
503 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  29.05 
 
 
503 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  24.87 
 
 
456 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  28.6 
 
 
464 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  28.82 
 
 
503 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  27.07 
 
 
359 aa  95.9  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  28.73 
 
 
464 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  25.33 
 
 
500 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7947  MmgE/PrpD family protein  29.43 
 
 
463 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386701  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3409  MmgE/PrpD family protein  30.85 
 
 
455 aa  95.5  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2695  MmgE/PrpD family protein  26.88 
 
 
469 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  25.06 
 
 
483 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  25.87 
 
 
468 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  29.22 
 
 
462 aa  93.6  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  25.69 
 
 
453 aa  93.2  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  25.06 
 
 
481 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  28.61 
 
 
486 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  29.06 
 
 
453 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  23.72 
 
 
450 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  25.64 
 
 
463 aa  91.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  25.89 
 
 
460 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  27.89 
 
 
489 aa  90.1  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  27.17 
 
 
461 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  23.04 
 
 
469 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  25.65 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  25.8 
 
 
476 aa  87.4  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  27.9 
 
 
465 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  24.19 
 
 
472 aa  87.4  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  25.73 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>