170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0022 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  100 
 
 
459 aa  941  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  52.6 
 
 
388 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  45.58 
 
 
393 aa  266  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  33.93 
 
 
414 aa  180  5e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  34.7 
 
 
397 aa  176  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  32.53 
 
 
401 aa  172  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  32.81 
 
 
410 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  33.68 
 
 
410 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  33.66 
 
 
420 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  33.25 
 
 
418 aa  167  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  33.25 
 
 
415 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  32.47 
 
 
410 aa  165  2e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  31.71 
 
 
411 aa  164  4e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  32.82 
 
 
418 aa  163  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  34.81 
 
 
409 aa  163  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  32.99 
 
 
408 aa  163  8e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  32.73 
 
 
409 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  30.69 
 
 
416 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  32.22 
 
 
410 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  32.09 
 
 
417 aa  159  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  31.7 
 
 
410 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  31.28 
 
 
417 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  33.78 
 
 
322 aa  158  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  5.77809e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  31.28 
 
 
417 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  31.28 
 
 
417 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  31.09 
 
 
412 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  31.09 
 
 
412 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  31.09 
 
 
412 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  31.19 
 
 
409 aa  156  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  31.62 
 
 
409 aa  156  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  31.62 
 
 
409 aa  156  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  31.47 
 
 
406 aa  154  3e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  32.82 
 
 
418 aa  154  3e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  31.34 
 
 
409 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  31.37 
 
 
409 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  31.79 
 
 
409 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  31.4 
 
 
328 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  33.25 
 
 
410 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  30.77 
 
 
410 aa  149  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  31.39 
 
 
314 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  29.9 
 
 
451 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  30.61 
 
 
426 aa  145  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  30.13 
 
 
312 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  31.66 
 
 
314 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  29.89 
 
 
314 aa  144  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  31.94 
 
 
410 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  30.43 
 
 
417 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  30.98 
 
 
319 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  30.3 
 
 
423 aa  142  1e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.117842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  29.35 
 
 
318 aa  141  2e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  30.16 
 
 
319 aa  142  2e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  29.87 
 
 
312 aa  142  2e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  30.16 
 
 
319 aa  142  2e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  30 
 
 
313 aa  140  4e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  31.07 
 
 
408 aa  140  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  29 
 
 
315 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  30.85 
 
 
409 aa  136  6e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  30.85 
 
 
409 aa  136  6e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  32.29 
 
 
409 aa  135  1e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  30.18 
 
 
411 aa  135  2e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  27.35 
 
 
360 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  29.19 
 
 
304 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  27.64 
 
 
347 aa  109  9e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  28.9 
 
 
304 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  28.9 
 
 
304 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  28.61 
 
 
303 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08676e-09 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  28.61 
 
 
303 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  27.22 
 
 
304 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.18769e-08 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  26.65 
 
 
304 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  30.48 
 
 
315 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  27.65 
 
 
315 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  29.8 
 
 
301 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  31.08 
 
 
324 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  29.61 
 
 
439 aa  101  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  28.76 
 
 
321 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  28.82 
 
 
379 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  28.5 
 
 
316 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  29.41 
 
 
438 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  25.82 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  26.83 
 
 
318 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  29.41 
 
 
438 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  29.08 
 
 
305 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  25.69 
 
 
304 aa  97.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  26.59 
 
 
304 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  25.54 
 
 
285 aa  96.7  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  27.95 
 
 
321 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  26.24 
 
 
291 aa  94.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  26.01 
 
 
304 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  27.22 
 
 
312 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  27.37 
 
 
316 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  27.41 
 
 
320 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  27.81 
 
 
416 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  27.81 
 
 
416 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  27.81 
 
 
416 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  25.45 
 
 
337 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  26.4 
 
 
358 aa  89.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  26.34 
 
 
305 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  26.79 
 
 
343 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  34.25 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  26.36 
 
 
303 aa  88.2  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>