294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2061 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  100 
 
 
272 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  93.38 
 
 
272 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  73.23 
 
 
274 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  76.25 
 
 
241 aa  353  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  61.19 
 
 
276 aa  323  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  59.4 
 
 
276 aa  311  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  60.08 
 
 
255 aa  299  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  38.96 
 
 
303 aa  161  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  40.32 
 
 
324 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  39.1 
 
 
311 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  36.92 
 
 
338 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  37.97 
 
 
310 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  39.74 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  36.36 
 
 
308 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  36.19 
 
 
326 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  36.4 
 
 
329 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  35.48 
 
 
456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  38.4 
 
 
330 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  31.47 
 
 
561 aa  133  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  31.47 
 
 
561 aa  133  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  34.26 
 
 
308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  33.06 
 
 
447 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  33.19 
 
 
577 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  32.75 
 
 
577 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  37.15 
 
 
444 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  35.8 
 
 
331 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  35.32 
 
 
439 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  34.98 
 
 
331 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  39.83 
 
 
315 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  36.07 
 
 
436 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  34.98 
 
 
308 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  31.1 
 
 
436 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  32.3 
 
 
456 aa  106  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  29.62 
 
 
417 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  33.2 
 
 
438 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
356 aa  82.4  0.000000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  22.82 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  31.01 
 
 
210 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  27.22 
 
 
358 aa  62.4  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003041  hypothetical protein  25.13 
 
 
210 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02845  hypothetical protein  25.91 
 
 
219 aa  59.7  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0628  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31 
 
 
230 aa  55.5  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308347  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  28.49 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  26 
 
 
354 aa  54.3  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  30.71 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
195 aa  53.9  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  27.06 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  31 
 
 
243 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  31.41 
 
 
672 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  31.33 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
246 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  28.17 
 
 
246 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.93 
 
 
447 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.7 
 
 
265 aa  52.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2676  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.93 
 
 
485 aa  52.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  26.74 
 
 
284 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.98 
 
 
244 aa  52.4  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 
230 aa  52.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1368  methyltransferase type 12  40.24 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 
252 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  33.93 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  42.31 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  31.52 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  41.25 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  31.74 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  28.7 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.68 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  30.28 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  30.28 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  30.28 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  30.28 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  30.28 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  31.64 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.68 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  30.46 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  27.78 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1042  Methyltransferase type 11  25 
 
 
195 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.520358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0911  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
247 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.43 
 
 
229 aa  49.3  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  36.63 
 
 
194 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  29.09 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  29.09 
 
 
269 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 
250 aa  48.9  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.07 
 
 
229 aa  49.3  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.13 
 
 
247 aa  48.9  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  34.91 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  34.91 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>